EMILIN1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2KA3, 2OII | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | EMILIN1, EMI, EMILIN, gp115, elastin microfibril interfacer 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 130660 MGI: 1926189 HomoloGene: 5117 GeneCards: EMILIN1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • extracellular matrix constituent conferring elasticity • identical protein binding • integrin binding involved in cell-matrix adhesion • extracellular matrix structural constituent |
---|
Клітинна компонента | • колаген • extracellular region • екзосома • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • integrin alpha4-beta1 complex • EMILIN complex • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • адгезія клітин • cell-matrix adhesion • cell migration • protein homotrimerization • aortic valve morphogenesis • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • positive regulation of cell-substrate adhesion • negative regulation of angiogenesis • extracellular matrix organization • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • negative regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of collagen biosynthetic process • elastic fiber assembly • negative regulation of cell activation • negative regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of extracellular matrix assembly • negative regulation of collagen fibril organization • negative regulation of macrophage migration |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 27.08 – 27.09 Mb | Хр. 5: 31.07 – 31.08 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EMILIN1 (англ. Elastin microfibril interfacer 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 016 амінокислот, а молекулярна маса — 106 667[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPRTLWSCY | | LCCLLTAAAG | | AASYPPRGFS | | LYTGSSGALS | | PGGPQAQIAP |
RPASRHRNWC | | AYVVTRTVSC | | VLEDGVETYV | | KYQPCAWGQP | | QCPQSIMYRR |
FLRPRYRVAY | | KTVTDMEWRC | | CQGYGGDDCA | | ESPAPALGPA | | SSTPRPLAQP |
ARPNLSGSSA | | GSPLSGLGGE | | GPGESEKVQQ | | LEEQVQSLTK | | ELQGLRGVLQ |
GLSGRLAEDV | | QRAVETAFNG | | RQQPADAAAR | | PGVHETLNEI | | QHQLQLLDTR |
VSTHDQELGH | | LNNHHGGSSS | | SGGSRAPAPA | | SAPPGPSEEL | | LRQLEQRLQE |
SCSVCLAGLD | | GFRRQQQEDR | | ERLRAMEKLL | | ASVEERQRHL | | AGLAVGRRPP |
QECCSPELGR | | RLAELERRLD | | VVAGSVTVLS | | GRRGTELGGA | | AGQGGHPPGY |
TSLASRLSRL | | EDRFNSTLGP | | SEEQEESWPG | | APGGLSHWLP | | AARGRLEQLG |
GLLANVSGEL | | GGRLDLLEEQ | | VAGAMQACGQ | | LCSGAPGEQD | | SQVSEILSAL |
ERRVLDSEGQ | | LRLVGSGLHT | | VEAAGEARQA | | TLEGLQEVVG | | RLQDRVDAQD |
ETAAEFTLRL | | NLTAARLGQL | | EGLLQAHGDE | | GCGACGGVQE | | ELGRLRDGVE |
RCSCPLLPPR | | GPGAGPGVGG | | PSRGPLDGFS | | VFGGSSGSAL | | QALQGELSEV |
ILSFSSLNDS | | LNELQTTVEG | | QGADLADLGA | | TKDRIISEIN | | RLQQEATEHA |
TESEERFRGL | | EEGQAQAGQC | | PSLEGRLGRL | | EGVCERLDTV | | AGGLQGLREG |
LSRHVAGLWA | | GLRETNTTSQ | | MQAALLEKLV | | GGQAGLGRRL | | GALNSSLQLL |
EDRLHQLSLK | | DLTGPAGEAG | | PPGPPGLQGP | | PGPAGPPGSP | | GKDGQEGPIG |
PPGPQGEQGV | | EGAPAAPVPQ | | VAFSAALSLP | | RSEPGTVPFD | | RVLLNDGGYY |
DPETGVFTAP | | LAGRYLLSAV | | LTGHRHEKVE | | AVLSRSNQGV | | ARVDSGGYEP |
EGLENKPVAE | | SQPSPGTLGV | | FSLILPLQAG | | DTVCVDLVMG | | QLAHSEEPLT |
IFSGALLYGD | | PELEHA |
Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 DOI:10.1074/mcp.M500324-MCP200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19880 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y6C2 (англ.) . Архів оригіналу за 9 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |