DPF2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3IUF

Ідентифікатори

Символи

DPF2, REQ, UBID4, ubi-d4, double PHD fingers 2, CSS7, SMARCG2

Зовнішні ІД

OMIM: 601671 MGI: 109529 HomoloGene: 21265 GeneCards: DPF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001106 transcription corepressor activity • histone acetyltransferase activity • GO:0031493 histone binding • H3K9me3 modified histone binding • lysine-acetylated histone binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • центросома • цитоплазма • гіалоплазма • histone acetyltransferase complex • nBAF complex
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • apoptotic signaling pathway • GO:0097285 апоптоз • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • нейробіологія розвитку • histone acetylation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of myeloid progenitor cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5977


19708

Ensembl


ENSG00000133884


ENSMUSG00000024826

UniProt


Q92785


Q61103

RefSeq (мРНК)


NM_006268 NM_001330308


NM_001291078 NM_011262

RefSeq (білок)


NP_001317237 NP_006259 NP_006259.1


NP_001278007 NP_035392

Локус (UCSC)

Хр. 11: 65.33 – 65.35 Mb

Хр. 19: 5.95 – 5.96 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DPF2 (англ. Double PHD fingers 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислот, а молекулярна маса — 44 155^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAVVENVVK	LLGEQYYKDA	MEQCHNYNAR	LCAERSVRLP	FLDSQTGVAQ
SNCYIWMEKR	HRGPGLASGQ	LYSYPARRWR	KKRRAHPPED	PRLSFPSIKP
DTDQTLKKEG	LISQDGSSLE	ALLRTDPLEK	RGAPDPRVDD	DSLGEFPVTN
SRARKRILEP	DDFLDDLDDE	DYEEDTPKRR	GKGKSKGKGV	GSARKKLDAS
ILEDRDKPYA	CDICGKRYKN	RPGLSYHYAH	SHLAEEEGED	KEDSQPPTPV
SQRSEEQKSK	KGPDGLALPN	NYCDFCLGDS	KINKKTGQPE	ELVSCSDCGR
SGHPSCLQFT	PVMMAAVKTY	RWQCIECKCC	NICGTSENDD	QLLFCDDCDR
GYHMYCLTPS	MSEPPEGSWS	CHLCLDLLKE	KASIYQNQNS	S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chestkov A.V., Baka I.D., Kost M.V., Georgiev G.P., Buchman V.L. (1996). The d4 gene family in the human genome. Genomics. 36: 174—177. PMID 8812431 DOI:10.1006/geno.1996.0440
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9964 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q92785 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.