DCP1A |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2WX3, 4B6H | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | DCP1A, HSA275986, Nbla00360, SMAD4IP1, SMIF, decapping mRNA 1A |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607010 MGI: 1923151 HomoloGene: 10178 GeneCards: DCP1A |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0010576 enzyme regulator activity • GO:0010577 enzyme activator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • hydrolase activity • identical protein binding • kinesin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • клітинне ядро • P-body • cytoplasmic ribonucleoprotein granule |
---|
Біологічний процес | • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA • protein localization to cytoplasmic stress granule • regulation of mRNA stability • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ef/PBB_GE_DCP1A_218508_at_fs.png/250px-PBB_GE_DCP1A_218508_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_018403 NM_001290204 NM_001290205 NM_001290206 NM_001290207 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001277133 NP_001277134 NP_001277135 NP_001277136 NP_060873 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 53.28 – 53.35 Mb | Хр. 14: 30.2 – 30.25 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DCP1A (англ. Decapping mRNA 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 582 амінокислот, а молекулярна маса — 63 309[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEALSRAGQE | | MSLAALKQHD | | PYITSIADLT | | GQVALYTFCP | | KANQWEKTDI |
EGTLFVYRRS | | ASPYHGFTIV | | NRLNMHNLVE | | PVNKDLEFQL | | HEPFLLYRNA |
SLSIYSIWFY | | DKNDCHRIAK | | LMADVVEEET | | RRSQQAARDK | | QSPSQANGCS |
DHRPIDILEM | | LSRAKDEYER | | NQMGDSNISS | | PGLQPSTQLS | | NLGSTETLEE |
MPSGSQDKSA | | PSGHKHLTVE | | ELFGTSLPKE | | QPAVVGLDSE | | EMERLPGDAS |
QKEPNSFLPF | | PFEQLGGAPQ | | SETLGVPSAA | | HHSVQPEITT | | PVLITPASIT |
QSNEKHAPTY | | TIPLSPVLSP | | TLPAEAPTAQ | | VPPSLPRNST | | MMQAVKTTPR |
QRSPLLNQPV | | PELSHASLIA | | NQSPFRAPLN | | VTNTAGTSLP | | SVDLLQKLRL |
TPQHDQIQTQ | | PLGKGAMVAS | | FSPAAGQLAT | | PESFIEPPSK | | TAAARVAASA |
SLSNMVLAPL | | QSMQQNQDPE | | VFVQPKVLSS | | AIQVAGAPLV | | TATTTAVSSV |
LLAPSVFQQT | | VTRSSDLERK | | ASSPSPLTIG | | TPESQRKPSI | | ILSKSQLQDT |
LIHLIKNDSS | | FLSTLHEVYL | | QVLTKNKDNH | | NL |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Lykke-Andersen J. (2002). Identification of a human decapping complex associated with hUpf proteins in nonsense-mediated decay. Mol. Cell. Biol. 22: 8114—8121. PMID 12417715 DOI:10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lykke-Andersen J., Wagner E. (2005). Recruitment and activation of mRNA decay enzymes by two ARE-mediated decay activation domains in the proteins TTP and BRF-1. Genes Dev. 19: 351—361. PMID 15687258 DOI:10.1101/gad.1282305
- Fenger-Groen M., Fillman C., Norrild B., Lykke-Andersen J. (2005). Multiple processing body factors and the ARE binding protein TTP activate mRNA decapping. Mol. Cell. 20: 905—915. PMID 16364915 DOI:10.1016/j.molcel.2005.10.031
- Cho H., Kim K.M., Kim Y.K. (2009). Human proline-rich nuclear receptor coregulatory protein 2 mediates an interaction between mRNA surveillance machinery and decapping complex. Mol. Cell. 33: 75—86. PMID 19150429 DOI:10.1016/j.molcel.2008.11.022
- Ingelfinger D., Arndt-Jovin D.J., Luehrmann R., Achsel T. (2002). The human LSm1-7 proteins colocalize with the mRNA-degrading enzymes Dcp1/2 and Xrnl in distinct cytoplasmic foci. RNA. 8: 1489—1501. PMID 12515382
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18714 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9NPI6 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |