CTSO

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1ATK, 1AU0, 1AU2, 1AU3, 1AU4, 1AYU, 1AYV, 1AYW, 1BGO, 1BY8, 1MEM, 1NL6, 1NLJ, 1Q6K, 1SNK, 1TU6, 1U9V, 1U9W, 1U9X, 1VSN, 1YK7, 1YK8, 1YT7, 2ATO, 2AUX, 2AUZ, 2BDL, 2R6N, 3C9E, 3H7D, 3KW9, 3KWB, 3KWZ, 3KX1, 3O0U, 3O1G, 3OVZ, 4DMX, 4DMY, 7PCK, 4LEG, 4N79, 4N8W

Ідентифікатори

Символи

CTSO, CTSO1, cathepsin O

Зовнішні ІД

OMIM: 600550 MGI: 2139628 HomoloGene: 1020 GeneCards: CTSO

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity
Клітинна компонента	• лізосома • міжклітинний простір
Біологічний процес	• proteolysis involved in cellular protein catabolic process • протеоліз
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1519


229445

Ensembl


ENSG00000256043


ENSMUSG00000028015

UniProt


P43234


Q8BM88

RefSeq (мРНК)


NM_001334


NM_177662

RefSeq (білок)


NP_001325


NP_808330

Локус (UCSC)

Хр. 4: 155.92 – 155.95 Mb

Хр. 3: 81.84 – 81.86 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CTSO (англ. Cathepsin O) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 321 амінокислот, а молекулярна маса — 35 958^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDVRALPWLP	WLLWLLCRGG	GDADSRAPFT	PTWPRSRERE	AAAFRESLNR
HRYLNSLFPS	ENSTAFYGIN	QFSYLFPEEF	KAIYLRSKPS	KFPRYSAEVH
MSIPNVSLPL	RFDWRDKQVV	TQVRNQQMCG	GCWAFSVVGA	VESAYAIKGK
PLEDLSVQQV	IDCSYNNYGC	NGGSTLNALN	WLNKMQVKLV	KDSEYPFKAQ
NGLCHYFSGS	HSGFSIKGYS	AYDFSDQEDE	MAKALLTFGP	LVVIVDAVSW
QDYLGGIIQH	HCSSGEANHA	VLITGFDKTG	STPYWIVRNS	WGSSWGVDGY
AHVKMGSNVC	GIADSVSSIF	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Локалізований у лізосомі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Velasco G., Ferrando A.A., Puente X.S., Sanchez L.M., Lopez-Otin C. (1994). Human cathepsin O. Molecular cloning from a breast carcinoma, production of the active enzyme in Escherichia coli, and expression analysis in human tissues. J. Biol. Chem. 269: 27136—27142. PMID 7929457

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2542 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P43234 (англ.) . Архів оригіналу за 5 лютого 2017. Процитовано 30 серпня 2017.