CSMD2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CSMD2, dJ1007G16.1, dJ1007G16.2, dJ947L8.1, CUB and Sushi multiple domains 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608398 MGI: 2386401 HomoloGene: 89034 GeneCards: CSMD2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
розлад дефіциту уваги та гіперактивності[1] |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 33.51 – 34.17 Mb | Хр. 4: 127.88 – 128.46 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CSMD2 (англ. CUB and Sushi multiple domains 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 487 амінокислот, а молекулярна маса — 380 039[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRLISIAPGP | | RWQVQSHHPR | | SAGQNCTFQL | | HGPNGTVESP | | GFPYGYPNYA |
NCTWTITAEE | | QHRIQLVFQS | | FALEEDFDVL | | SVFDGPPQPE | | NLRTRLTGFQ |
LPATIVSAAT | | TLSLRLISDY | | AVSAQGFHAT | | YEVLPSHTCG | | NPGRLPNGIQ |
QGSTFNLGDK | | VRYSCNLGFF | | LEGHAVLTCH | | AGSENSATWD | | FPLPSCRADD |
ACGGTLRGQS | | GIISSPHFPS | | EYHNNADCTW | | TILAELGDTI | | ALVFIDFQLE |
DGYDFLEVTG | | TEGSSLWFTG | | ASLPAPVISS | | KNWLRLHFTS | | DGNHRQRGFS |
AQYQVKKQIE | | LKSRGVKLMP | | SKDNSQKTSV | | LTQVGVSQGH | | NMCPDPGIPE |
RGKRLGSDFR | | LGSSVQFTCN | | EGYDLQGSKR | | ITCMKVSDMF | | AAWSDHRPVC |
RARMCDAHLR | | GPSGIITSPN | | FPIQYDNNAH | | CVWIITALNP | | SKVIKLAFEE |
FDLERGYDTL | | TVGDGGQDGD | | QKTVLYILTG | | TSVPDLIVST | | NHQMWLLFQT |
DGSGSSLGFK | | ASYEEIEQGS | | CGDPGIPAYG | | RREGSRFHHG | | DTLKFECQPA |
FELVGQKAIT | | CQKNNQWSAK | | KPGCVFSCFF | | NFTSPSGVVL | | SPNYPEDYGN |
HLHCVWLILA | | RPESRIHLAF | | NDIDVEPQFD | | FLVIKDGATA | | EAPVLGTFSG |
NQLPSSITSS | | GHVARLEFQT | | DHSTGKRGFN | | ITFTTFRHNE | | CPDPGVPVNG |
KRFGDSLQLG | | SSISFLCDEG | | FLGTQGSETI | | TCVLKEGSVV | | WNSAVLRCEA |
PCGGHLTSPS | | GTILSPGWPG | | FYKDALSCAW | | VIEAQPGYPI | | KITFDRFKTE |
VNYDTLEVRD | | GRTYSAPLIG | | VYHGTQVPQF | | LISTSNYLYL | | LFSTDKSHSD |
IGFQLRYETI | | TLQSDHCLDP | | GIPVNGQRHG | | NDFYVGALVT | | FSCDSGYTLS |
DGEPLECEPN | | FQWSRALPSC | | EALCGGFIQG | | SSGTILSPGF | | PDFYPNNLNC |
TWIIETSHGK | | GVFFTFHTFH | | LESGHDYLLI | | TENGSFTQPL | | RQLTGSRLPA |
PISAGLYGNF | | TAQVRFISDF | | SMSYEGFNIT | | FSEYDLEPCE | | EPEVPAYSIR |
KGLQFGVGDT | | LTFSCFPGYR | | LEGTARITCL | | GGRRRLWSSP | | LPRCVAECGN |
SVTGTQGTLL | | SPNFPVNYNN | | NHECIYSIQT | | QPGKGIQLKA | | RAFELSEGDV |
LKVYDGNNNS | | ARLLGVFSHS | | EMMGVTLNST | | SSSLWLDFIT | | DAENTSKGFE |
LHFSSFELIK | | CEDPGTPKFG | | YKVHDEGHFA | | GSSVSFSCDP | | GYSLRGSEEL |
LCLSGERRTW | | DRPLPTCVAE | | CGGTVRGEVS | | GQVLSPGYPA | | PYEHNLNCIW |
TIEAEAGCTI | | GLHFLVFDTE | | EVHDVLRIWD | | GPVESGVLLK | | ELSGPALPKD |
LHSTFNSVVL | | QFSTDFFTSK | | QGFAIQFSVS | | TATSCNDPGI | | PQNGSRSGDS |
WEAGDSTVFQ | | CDPGYALQGS | | AEISCVKIEN | | RFFWQPSPPT | | CIAPCGGDLT |
GPSGVILSPN | | YPEPYPPGKE | | CDWKVTVSPD | | YVIALVFNIF | | NLEPGYDFLH |
IYDGRDSLSP | | LIGSFYGSQL | | PGRIESSSNS | | LFLAFRSDAS | | VSNAGFVIDY |
TENPRESCFD | | PGSIKNGTRV | | GSDLKLGSSV | | TYYCHGGYEV | | EGTSTLSCIL |
GPDGKPVWNN | | PRPVCTAPCG | | GQYVGSDGVV | | LSPNYPQNYT | | SGQICLYFVT |
VPKDYVVFGQ | | FAFFHTALND | | VVEVHDGHSQ | | HSRLLSSLSG | | SHTGESLPLA |
TSNQVLIKFS | | AKGLAPARGF | | HFVYQAVPRT | | SATQCSSVPE | | PRYGKRLGSD |
FSVGAIVRFE | | CNSGYALQGS | | PEIECLPVPG | | ALAQWNVSAP | | TCVVPCGGNL |
TERRGTILSP | | GFPEPYLNSL | | NCVWKIVVPE | | GAGIQIQVVS | | FVTEQNWDSL |
EVFDGADNTV | | TMLGSFSGTT | | VPALLNSTSN | | QLYLHFYSDI | | SVSAAGFHLE |
YKTVGLSSCP | | EPAVPSNGVK | | TGERYLVNDV | | VSFQCEPGYA | | LQGHAHISCM |
PGTVRRWNYP | | PPLCIAQCGG | | TVEEMEGVIL | | SPGFPGNYPS | | NMDCSWKIAL |
PVGFGAHIQF | | LNFSTEPNHD | | YIEIRNGPYE | | TSRMMGRFSG | | SELPSSLLST |
SHETTVYFHS | | DHSQNRPGFK | | LEYQDLTYSH | | QISSFLRGFD | | LSELERTNST |
PPVAASYVWD | | LDPGCEAYEL | | QECPDPEPFA | | NGIVRGAGYN | | VGQSVTFECL |
PGYQLTGHPV | | LTCQHGTNRN | | WDHPLPKCEV | | PCGGNITSSN | | GTVYSPGFPS |
PYSSSQDCVW | | LITVPIGHGV | | RLNLSLLQTE | | PSGDFITIWD | | GPQQTAPRLG |
VFTRSMAKKT | | VQSSSNQVLL | | KFHRDAATGG | | IFAIAFSAYP | | LTKCPPPTIL |
PNAEVVTENE | | EFNIGDIVRY | | RCLPGFTLVG | | NEILTCKLGT | | YLQFEGPPPI |
CEVHCPTNEL | | LTDSTGVILS | | QSYPGSYPQF | | QTCSWLVRVE | | PDYNISLTVE |
YFLSEKQYDE | | FEIFDGPSGQ | | SPLLKALSGN | | YSAPLIVTSS | | SNSVYLRWSS |
DHAYNRKGFK | | IRYSAPYCSL | | PRAPLHGFIL | | GQTSTQPGGS | | IHFGCNAGYR |
LVGHSMAICT | | RHPQGYHLWS | | EAIPLCQALS | | CGLPEAPKNG | | MVFGKEYTVG |
TKAMYSCSEG | | YHLQAGAEAT | | AECLDTGLWS | | NRNVPPQCVP | | VTCPDVSSIS |
VEHGRWRLIF | | ETQYQFQAQL | | MLICDPGYYY | | TGQRVIRCQA | | NGKWSLGDST |
PTCRIISCGE | | LPIPPNGHRI | | GTLSVYGATA | | IFSCNSGYTL | | VGSRVRECMA |
NGLWSGSEVR | | CLAGHCGTPE | | PIVNGHINGE | | NYSYRGSVVY | | QCNAGFRLIG |
MSVRICQQDH | | HWSGKTPFCV | | LVSCGHPGSP | | PHSQMSGDSY | | TVGAVVRYSC |
IGKRTLVGNS | | TRMCGLDGHW | | TGSLPHCSGT | | SVGVCGDPGI | | PAHGIRLGDS |
FDPGTVMRFS | | CEAGHVLRGS | | SERTCQANGS | | WSGSQPECGV | | ISCGNPGTPS |
NARVVFSDGL | | VFSSSIVYEC | | REGYYATGLL | | SRHCSVNGTW | | TGSDPECLVI |
NCGDPGIPAN | | GLRLGNDFRY | | NKTVTYQCVP | | GYMMESHRVS | | VLSCTKDRTW |
NGTKPVCKAL | | MCKPPPLIPN | | GKVVGSDFMW | | GSSVTYACLE | | GYQLSLPAVF |
TCEGNGSWTG | | ELPQCFPVFC | | GDPGVPSRGR | | REDRGFSYRS | | SVSFSCHPPL |
VLVGSPRRFC | | QSDGTWSGTQ | | PSCIDPTLTT | | CADPGVPQFG | | IQNNSQGYQV |
GSTVLFRCQK | | GYLLQGSTTR | | TCLPNLTWSG | | TPPDCVPHHC | | RQPETPTHAN |
VGALDLPSMG | | YTLIYSCQEG | | FSLKGGSEHR | | TCKADGSWTG | | KPPICLEVRP |
SGRPINTARE | | PPLTQALIPG | | DVFAKNSLWK | | GAYEYQGKKQ | | PAMLRVTGFQ |
VANSKVNATM | | IDHSGVELHL | | AGTYKKEDFH | | LLLQVYQITG | | PVEIFMNKFK |
DDHWALDGHV | | SSESSGATFI | | YQGSVKGQGF | | GQFGFQRLDL | | RLLESDPESI |
GRHFASNSSS | | VAAAILVPFI | | ALIIAGFVLY | | LYKHRRRPKV | | PFNGYAGHEN |
TNVRATFENP | | MYDRNIQPTD | | IMASEAEFTV | | STVCTAV |
Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Lau W.L., Scholnick S.B. (2003). Identification of two new members of the CSMD gene family. Genomics. 82: 412—415. PMID 12906867 DOI:10.1016/S0888-7543(03)00149-6
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CSMD2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19290 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q7Z408 (англ.) . Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |