CNTF

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1CNT

Ідентифікатори

Символи

CNTF, Hciliary neurotrophic factor

Зовнішні ІД

OMIM: 118945 MGI: 88439 HomoloGene: 8288 GeneCards: CNTF

Онтологія гена
Молекулярна функція	• interleukin-6 receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ciliary neurotrophic factor receptor binding • growth factor activity • cytokine activity • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • CRLF-CLCF1 complex • extracellular region • аксон • міжклітинний простір
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • диференціація клітин • muscle organ morphogenesis • neuron development • regulation of retinal cell programmed cell death • нейробіологія розвитку • ciliary neurotrophic factor-mediated signaling pathway • multicellular organism development • negative regulation of photoreceptor cell differentiation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of axon regeneration • positive regulation of cell population proliferation • astrocyte activation • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • ріст • regulation of signaling receptor activity • cytokine-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1270


12803

Ensembl


ENSG00000242689


ENSMUSG00000079415

UniProt


P26441


P51642

RefSeq (мРНК)


NM_000614


NM_053007 NM_170786

RefSeq (білок)


NP_000605


NP_740756

Локус (UCSC)

Хр. 11: 58.62 – 58.63 Mb

Хр. 19: 12.74 – 12.74 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CNTF (англ. Ciliary neurotrophic factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 200 амінокислот, а молекулярна маса — 22 931^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAFTEHSPLT	PHRRDLCSRS	IWLARKIRSD	LTALTESYVK	HQGLNKNINL
DSADGMPVAS	TDQWSELTEA	ERLQENLQAY	RTFHVLLARL	LEDQQVHFTP
TEGDFHQAIH	TLLLQVAAFA	YQIEELMILL	EYKIPRNEAD	GMPINVGDGG
LFEKKLWGLK	VLQELSQWTV	RSIHDLRFIS	SHQTGIPARG	SHYIANNKKM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів росту, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез. Локалізований у цитоплазмі.

Література

McDonald J.R., Ko C., Mismer D., Smith D.J., Collins F. (1991). Expression and characterization of recombinant human ciliary neurotrophic factor from Escherichia coli. Biochim. Biophys. Acta. 1090: 70—80. PMID 1883844 DOI:10.1016/0167-4781(91)90038-N
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
McDonald N.Q., Panayotatos N., Hendrickson W.A. (1995). Crystal structure of dimeric human ciliary neurotrophic factor determined by MAD phasing. EMBO J. 14: 2689—2699. PMID 7796798

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2169 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P26441 (англ.) . Архів оригіналу за 29 жовтня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.