CNOT8

Ідентифікатори

Символи

CNOT8, CAF1, CALIF, Caf1b, POP2, hCAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 8

Зовнішні ІД

OMIM: 603731 MGI: 1916375 HomoloGene: 48304 GeneCards: CNOT8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• poly(A)-specific ribonuclease activity • 3'-5'-exoribonuclease activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • CCR4-NOT complex • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • P-body • CCR4-NOT core complex
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • positive regulation of mRNA catabolic process • transcription, DNA-templated • gene silencing by miRNA • positive regulation of cell population proliferation • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • Сайленсинг генів • regulation of translation • negative regulation of cell population proliferation • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • negative regulation of translation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9337


69125

Ensembl


ENSG00000155508


ENSMUSG00000020515

UniProt


Q9UFF9


Q9D8X5

RefSeq (мРНК)

NM_001301073 NM_001301074 NM_001301075 NM_001301077 NM_001301080
NM_001301082 NM_001301083 NM_001301086 NM_004779


NM_026949 NM_001356477 NM_001363084 NM_001363085 NM_001363086

RefSeq (білок)

NP_001288002 NP_001288003 NP_001288004 NP_001288006 NP_001288009
NP_001288011 NP_001288012 NP_001288015 NP_004770


NP_081225 NP_001343406 NP_001350013 NP_001350014 NP_001350015

Локус (UCSC)

Хр. 5: 154.86 – 154.88 Mb

Хр. 11: 57.99 – 58.01 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CNOT8 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 292 амінокислот, а молекулярна маса — 33 540^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPAALVENSQ	VICEVWASNL	EEEMRKIREI	VLSYSYIAMD	TEFPGVVVRP
IGEFRSSIDY	QYQLLRCNVD	LLKIIQLGLT	FTNEKGEYPS	GINTWQFNFK
FNLTEDMYSQ	DSIDLLANSG	LQFQKHEEEG	IDTLHFAELL	MTSGVVLCDN
VKWLSFHSGY	DFGYMVKLLT	DSRLPEEEHE	FFHILNLFFP	SIYDVKYLMK
SCKNLKGGLQ	EVADQLDLQR	IGRQHQAGSD	SLLTGMAFFR	MKELFFEDSI
DDAKYCGRLY	GLGTGVAQKQ	NEDVDSAQEK	MSILAIINNM	QQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Fidler C., Wainscoat J.S., Boultwood J. (1999). The human POP2 gene: identification, sequencing, and mapping to the critical region of the 5q- syndrome. Genomics. 56: 134—136. PMID 10036195 DOI:10.1006/geno.1998.5687
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bianchin C., Mauxion F., Sentis S., Seraphin B., Corbo L. (2005). Conservation of the deadenylase activity of proteins of the Caf1 family in human. RNA. 11: 487—494. PMID 15769875 DOI:10.1261/rna.7135305
Aslam A., Mittal S., Koch F., Andrau J.C., Winkler G.S. (2009). The Ccr4-NOT deadenylase subunits CNOT7 and CNOT8 have overlapping roles and modulate cell proliferation. Mol. Biol. Cell. 20: 3840—3850. PMID 19605561 DOI:10.1091/mbc.E09-02-0146
Piao X., Zhang X., Wu L., Belasco J.G. (2010). CCR4-NOT deadenylates mRNA associated with complexes in human cells. Mol. Cell. Biol. 30: 1486—1494. PMID 20065043 DOI:10.1128/MCB.01481-09
Doidge R., Mittal S., Aslam A., Winkler G.S. (2012). The anti-proliferative activity of BTG/TOB proteins is mediated via the Caf1a (CNOT7) and Caf1b (CNOT8) deadenylase subunits of the Ccr4-not complex. PLoS ONE. 7: E51331—E51331. PMID 23236473 DOI:10.1371/journal.pone.0051331

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9207 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UFF9 (англ.) . Архів оригіналу за 26 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.