CNOT2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4C0D, 4C0F, 5FU6, 5FU7

Ідентифікатори

Символи

CNOT2, CDC36, NOT2, NOT2H, HSPC131, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, IDNADFS

Зовнішні ІД

OMIM: 604909 MGI: 1919318 HomoloGene: 40953 GeneCards: CNOT2

Пов'язані генетичні захворювання

бічний аміотрофічний склероз^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• poly(A)-specific ribonuclease activity • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • мембрана • CCR4-NOT complex • P-body • CCR4-NOT core complex • клітинне ядро • гіалоплазма • клітинна мембрана
Біологічний процес	• nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • negative regulation of translation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of stem cell population maintenance • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly • trophectodermal cell differentiation • Сайленсинг генів • negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • regulation of translation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4848


72068

Ensembl


ENSG00000111596


ENSMUSG00000020166

UniProt


Q9NZN8


Q8C5L3

RefSeq (мРНК)


NM_001199302 NM_001199303 NM_014515

NM_001037846 NM_001037847 NM_001037848 NM_028082 NM_001359247
NM_001359248 NM_001359249 NM_001359250 NM_001359251 NM_001359252 NM_001359253 NM_001359563

RefSeq (білок)


NP_001186231 NP_001186232 NP_055330

NP_001032935 NP_001032936 NP_001032937 NP_082358 NP_001346176
NP_001346177 NP_001346178 NP_001346179 NP_001346180 NP_001346181 NP_001346182 NP_001346492

Локус (UCSC)

Хр. 12: 70.24 – 70.35 Mb

Хр. 10: 116.32 – 116.42 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CNOT2 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 59 738^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVRTDGHTLS	EKRNYQVTNS	MFGASRKKFV	EGVDSDYHDE	NMYYSQSSMF
PHRSEKDMLA	SPSTSGQLSQ	FGASLYGQQS	ALGLPMRGMS	NNTPQLNRSL
SQGTQLPSHV	TPTTGVPTMS	LHTPPSPSRG	ILPMNPRNMM	NHSQVGQGIG
IPSRTNSMSS	SGLGSPNRSS	PSIICMPKQQ	PSRQPFTVNS	MSGFGMNRNQ
AFGMNNSLSS	NIFNGTDGSE	NVTGLDLSDF	PALADRNRRE	GSGNPTPLIN
PLAGRAPYVG	MVTKPANEQS	QDFSIHNEDF	PALPGSSYKD	PTSSNDDSKS
NLNTSGKTTS	STDGPKFPGD	KSSTTQNNNQ	QKKGIQVLPD	GRVTNIPQGM
VTDQFGMIGL	LTFIRAAETD	PGMVHLALGS	DLTTLGLNLN	SPENLYPKFA
SPWASSPCRP	QDIDFHVPSE	YLTNIHIRDK	LAAIKLGRYG	EDLLFYLYYM
NGGDVLQLLA	AVELFNRDWR	YHKEERVWIT	RAPGMEPTMK	TNTYERGTYY
FFDCLNWRKV	AKEFHLEYDK	LEERPHLPST	FNYNPAQQAF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zwartjes C.G., Jayne S., van den Berg D.L., Timmers H.T. (2004). Repression of promoter activity by CNOT2, a subunit of the transcription regulatory Ccr4-not complex. J. Biol. Chem. 279: 10848—10854. PMID 14707134 DOI:10.1074/jbc.M311747200
Jayne S., Zwartjes C.G., van Schaik F.M., Timmers H.T. (2006). Involvement of the SMRT/NCoR-HDAC3 complex in transcriptional repression by the CNOT2 subunit of the human Ccr4-Not complex. Biochem. J. 398: 461—467. PMID 16712523 DOI:10.1042/BJ20060406

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CNOT2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7878 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NZN8 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.