CLDN19

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3X29

Ідентифікатори

Символи

CLDN19, HOMG5, claudin 19

Зовнішні ІД

OMIM: 610036 MGI: 3033992 HomoloGene: 17528 GeneCards: CLDN19

Пов'язані генетичні захворювання

renal hypomagnesemia 5 with ocular involvement^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural molecule activity • identical protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • basolateral plasma membrane • apical junction complex • клітинне ядро • bicellular tight junction • мембрана
Біологічний процес	• calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules • apical junction assembly • neuronal action potential propagation • відповідь на стимул • зір • tight junction organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


149461


242653

Ensembl


ENSG00000164007


ENSMUSG00000066058

UniProt


Q8N6F1


Q9ET38

RefSeq (мРНК)


NM_148960 NM_001123395 NM_001185117


NM_001038590 NM_153105

RefSeq (білок)


NP_001116867 NP_001172046 NP_683763


NP_001033679 NP_694745

Локус (UCSC)

Хр. 1: 42.73 – 42.74 Mb

Хр. 4: 119.11 – 119.12 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLDN19 (англ. Claudin 19) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 224 амінокислот, а молекулярна маса — 23 229^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MANSGLQLLG	YFLALGGWVG	IIASTALPQW	KQSSYAGDAI	ITAVGLYEGL
WMSCASQSTG	QVQCKLYDSL	LALDGHIQSA	RALMVVAVLL	GFVAMVLSVV
GMKCTRVGDS	NPIAKGRVAI	AGGALFILAG	LCTLTAVSWY	ATLVTQEFFN
PSTPVNARYE	FGPALFVGWA	SAGLAVLGGS	FLCCTCPEPE	RPNSSPQPYR
PGPSAAAREP	VVKLPASAKG	PLGV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CLDN19 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2040 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8N6F1 (англ.) . Архів оригіналу за 18 лютого 2018. Процитовано 28 серпня 2017.