CLDN1

Ідентифікатори

Символи

CLDN1, CLD1, ILVASC, SEMP1, claudin 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603718 MGI: 1276109 HomoloGene: 9620 GeneCards: CLDN1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • structural molecule activity • identical protein binding • virus receptor activity
Клітинна компонента	• мембрана • integral component of membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • apical plasma membrane • lateral plasma membrane • bicellular tight junction • цитоплазма • basolateral plasma membrane
Біологічний процес	• viral entry into host cell • cell-cell junction organization • calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules • GO:0022415 viral process • protein homooligomerization • protein heterooligomerization • establishment of skin barrier • bicellular tight junction assembly • GO:0010260 старіння людини • establishment of blood-nerve barrier • response to toxic substance • response to lipopolysaccharide • hyperosmotic salinity response • response to ethanol • xenobiotic transport across blood-nerve barrier • response to interleukin-18 • cellular response to lead ion • cellular response to interferon-gamma • cellular response to tumor necrosis factor • response to dexamethasone • cellular response to transforming growth factor beta stimulus • establishment of endothelial intestinal barrier • liver regeneration • positive regulation of bicellular tight junction assembly • cellular response to butyrate
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9076


12737

Ensembl


ENSG00000163347


ENSMUSG00000022512

UniProt


O95832


O88551

RefSeq (мРНК)


NM_021101


NM_016674

RefSeq (білок)


NP_066924


NP_057883

Локус (UCSC)

Хр. 3: 190.31 – 190.32 Mb

Хр. 16: 26.18 – 26.19 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLDN1 (англ. Claudin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 22 744^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MANAGLQLLG	FILAFLGWIG	AIVSTALPQW	RIYSYAGDNI	VTAQAMYEGL
WMSCVSQSTG	QIQCKVFDSL	LNLSSTLQAT	RALMVVGILL	GVIAIFVATV
GMKCMKCLED	DEVQKMRMAV	IGGAIFLLAG	LAILVATAWY	GNRIVQEFYD
PMTPVNARYE	FGQALFTGWA	AASLCLLGGA	LLCCSCPRKT	TSYPTPRPYP
KPAPSSGKDY	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

Kraemer F., White K., Kubbies M., Swisshelm K.L., Weber B.H.F. (2000). Genomic organization of claudin-1 and its assessment in hereditary and sporadic breast cancer. Hum. Genet. 107: 249—256. PMID 11071387 DOI:10.1007/s004390000375
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Che P., Tang H., Li Q. (2013). The interaction between claudin-1 and dengue viral prM/M protein for its entry. Virology. 446: 303—313. PMID 24074594 DOI:10.1016/j.virol.2013.08.009

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2032 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O95832 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.