CLASP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3WOY

Ідентифікатори

Символи

CLASP2, cytoplasmic linker associated protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 605853 MGI: 1923749 HomoloGene: 24944 GeneCards: CLASP2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein tyrosine kinase binding • dystroglycan binding • microtubule binding • microtubule plus-end binding • actin filament binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinetochore binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • комплекс Ґольджі • cell projection • kinetochore microtubule • мембрана • focal adhesion • клітинна мембрана • axonal growth cone • веретено поділу • центр організації мікротрубочок • хромосома • ruffle membrane • trans-Golgi network • cell cortex • cell leading edge • cortical microtubule plus-end • cytoplasmic microtubule • mitotic spindle • basal cortex • мікротрубочка • центромера • цитоскелет • кінетохор • гіалоплазма
Біологічний процес	• vesicle targeting • regulation of actin cytoskeleton organization • regulation of axon extension • Golgi organization • GO:0043148 mitotic spindle organization • regulation of epithelial to mesenchymal transition • positive regulation of epithelial cell migration • exit from mitosis • поділ клітини • establishment or maintenance of cell polarity • positive regulation of extracellular matrix disassembly • positive regulation of basement membrane assembly involved in embryonic body morphogenesis • negative regulation of microtubule depolymerization • microtubule anchoring • regulation of microtubule-based process • regulation of microtubule polymerization • regulation of microtubule polymerization or depolymerization • negative regulation of wound healing, spreading of epidermal cells • клітинний цикл • positive regulation of exocytosis • negative regulation of stress fiber assembly • microtubule organizing center organization • negative regulation of focal adhesion assembly • regulation of gastrulation • microtubule cytoskeleton organization • Нуклеація елементів цитоскелету • platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway • sister chromatid cohesion • protein localization to plasma membrane
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23122


76499

Ensembl


ENSG00000163539


ENSMUSG00000033392

UniProt


O75122


Q8BRT1

RefSeq (мРНК)

NM_001207044 NM_015097 NM_001365627 NM_001365628 NM_001365629
NM_001365630 NM_001365631 NM_001365632 NM_001365633 NM_001365634 NM_001375694 NM_001375697 NM_001375700 NM_001375701 NM_001375703 NM_001375705 NM_001375713 NM_001375715 NM_001375716 NM_001375718 NM_001375720

NM_001081960 NM_001114347 NM_001286599 NM_001286600 NM_001286601
NM_001286602 NM_001286603 NM_029633

RefSeq (білок)

NP_001193973 NP_055912 NP_001352556 NP_001352557 NP_001352558
NP_001352559 NP_001352560 NP_001352561 NP_001352562 NP_001352563 NP_001362623 NP_001362626 NP_001362629 NP_001362630 NP_001362632 NP_001362634 NP_001362642 NP_001362644 NP_001362645 NP_001362647 NP_001362649

NP_001075429 NP_001107819 NP_001273528 NP_001273529 NP_001273530
NP_001273531 NP_001273532 NP_083909

Локус (UCSC)

Хр. 3: 33.5 – 33.72 Mb

Хр. 9: 113.74 – 113.92 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLASP2 (англ. Cytoplasmic linker associated protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 294 амінокислот, а молекулярна маса — 141 133^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAMGDDKSFD	DEESVDGNRP	SSAASAFKVP	APKTSGNPAN	SARKPGSAGG
PKVGGASKEG	GAGAVDEDDF	IKAFTDVPSI	QIYSSRELEE	TLNKIREILS
DDKHDWDQRA	NALKKIRSLL	VAGAAQYDCF	FQHLRLLDGA	LKLSAKDLRS
QVVREACITV	AHLSTVLGNK	FDHGAEAIVP	TLFNLVPNSA	KVMATSGCAA
IRFIIRHTHV	PRLIPLITSN	CTSKSVPVRR	RSFEFLDLLL	QEWQTHSLER
HAAVLVETIK	KGIHDADAEA	RVEARKTYMG	LRNHFPGEAE	TLYNSLEPSY
QKSLQTYLKS	SGSVASLPQS	DRSSSSSQES	LNRPFSSKWS	TANPSTVAGR
VSAGSSKASS	LPGSLQRSRS	DIDVNAAAGA	KAHHAAGQSV	RRGRLGAGAL
NAGSYASLED	TSDKLDGTAS	EDGRVRAKLS	APLAGMGNAK	ADSRGRSRTK
MVSQSQPGSR	SGSPGRVLTT	TALSTVSSGV	QRVLVNSASA	QKRSKIPRSQ
GCSREASPSR	LSVARSSRIP	RPSVSQGCSR	EASRESSRDT	SPVRSFQPLA
SRHHSRSTGA	LYAPEVYGAS	GPGYGISQSS	RLSSSVSAMR	VLNTGSDVEE
AVADALKKPA	RRRYESYGMH	SDDDANSDAS	SACSERSYSS	RNGSIPTYMR
QTEDVAEVLN	RCASSNWSER	KEGLLGLQNL	LKNQRTLSRV	ELKRLCEIFT
RMFADPHGKR	VFSMFLETLV	DFIQVHKDDL	QDWLFVLLTQ	LLKKMGADLL
GSVQAKVQKA	LDVTRESFPN	DLQFNILMRF	TVDQTQTPSL	KVKVAILKYI
ETLAKQMDPG	DFINSSETRL	AVSRVITWTT	EPKSSDVRKA	AQSVLISLFE
LNTPEFTMLL	GALPKTFQDG	ATKLLHNHLR	NTGNGTQSSM	GSPLTRPTPR
SPANWSSPLT	SPTNTSQNTL	SPSAFDYDTE	NMNSEDIYSS	LRGVTEAIQN
FSFRSQEDMN	EPLKRDSKKD	DGDSMCGGPG	MSDPRAGGDA	TDSSQTALDN
KASLLHSMPT	HSSPRSRDYN	PYNYSDSISP	FNKSALKEAM	FDDDADQFPD
DLSLDHSDLV	AELLKELSNH	NERVEERKIA	LYELMKLTQE	ESFSVWDEHF
KTILLLLLET	LGDKEPTIRA	LALKVLREIL	RHQPARFKNY	AELTVMKTLE
AHKDPHKEVV	RSAEEAASVL	ATSISPEQCI	KVLCPIIQTA	DYPINLAAIK
MQTKVIERVS	KETLNLLLPE	IMPGLIQGYD	NSESSVRKAC	VFCLVAVHAV
IGDELKPHLS	QLTGSKMKLL	NLYIKRAQTG	SGGADPTTDV	SGQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках, хромосомах, центромерах, апараті гольджі, кінетохорі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wittmann T., Waterman-Storer C.M. (2005). Spatial regulation of CLASP affinity for microtubules by Rac1 and GSK3beta in migrating epithelial cells. J. Cell Biol. 169: 929—939. PMID 15955847 DOI:10.1083/jcb.200412114
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Zaoui K., Benseddik K., Daou P., Salaun D., Badache A. (2010). ErbB2 receptor controls microtubule capture by recruiting ACF7 to the plasma membrane of migrating cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 18517—18522. PMID 20937854 DOI:10.1073/pnas.1000975107
Maki T., Grimaldi A.D., Fuchigami S., Kaverina I., Hayashi I. (2015). CLASP2 has two distinct TOG domains that contribute differently to microtubule dynamics. J. Mol. Biol. 427: 2379—2395. PMID 26003921 DOI:10.1016/j.jmb.2015.05.012
Wittmann T., Waterman-Storer C.M. (2005). J. Cell Biol. 171: 393—393. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17078 (англ.) . Архів оригіналу за 20 червня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O75122 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.