CLASP2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CLASP2, cytoplasmic linker associated protein 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605853 MGI: 1923749 HomoloGene: 24944 GeneCards: CLASP2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein tyrosine kinase binding • dystroglycan binding • microtubule binding • microtubule plus-end binding • actin filament binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinetochore binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • комплекс Ґольджі • cell projection • kinetochore microtubule • мембрана • focal adhesion • клітинна мембрана • axonal growth cone • веретено поділу • центр організації мікротрубочок • хромосома • ruffle membrane • trans-Golgi network • cell cortex • cell leading edge • cortical microtubule plus-end • cytoplasmic microtubule • mitotic spindle • basal cortex • мікротрубочка • центромера • цитоскелет • кінетохор • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • vesicle targeting • regulation of actin cytoskeleton organization • regulation of axon extension • Golgi organization • GO:0043148 mitotic spindle organization • regulation of epithelial to mesenchymal transition • positive regulation of epithelial cell migration • exit from mitosis • поділ клітини • establishment or maintenance of cell polarity • positive regulation of extracellular matrix disassembly • positive regulation of basement membrane assembly involved in embryonic body morphogenesis • negative regulation of microtubule depolymerization • microtubule anchoring • regulation of microtubule-based process • regulation of microtubule polymerization • regulation of microtubule polymerization or depolymerization • negative regulation of wound healing, spreading of epidermal cells • клітинний цикл • positive regulation of exocytosis • negative regulation of stress fiber assembly • microtubule organizing center organization • negative regulation of focal adhesion assembly • regulation of gastrulation • microtubule cytoskeleton organization • Нуклеація елементів цитоскелету • platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway • sister chromatid cohesion • protein localization to plasma membrane |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/07/PBB_GE_CLASP2_212306_at_fs.png/250px-PBB_GE_CLASP2_212306_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f3/PBB_GE_CLASP2_212308_at_fs.png/250px-PBB_GE_CLASP2_212308_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/52/PBB_GE_CLASP2_212309_at_fs.png/250px-PBB_GE_CLASP2_212309_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001207044 NM_015097 NM_001365627 NM_001365628 NM_001365629
| NM_001365630 NM_001365631 NM_001365632 NM_001365633 NM_001365634 NM_001375694 NM_001375697 NM_001375700 NM_001375701 NM_001375703 NM_001375705 NM_001375713 NM_001375715 NM_001375716 NM_001375718 NM_001375720 |
| NM_001081960 NM_001114347 NM_001286599 NM_001286600 NM_001286601
| NM_001286602 NM_001286603 NM_029633 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001193973 NP_055912 NP_001352556 NP_001352557 NP_001352558
| NP_001352559 NP_001352560 NP_001352561 NP_001352562 NP_001352563 NP_001362623 NP_001362626 NP_001362629 NP_001362630 NP_001362632 NP_001362634 NP_001362642 NP_001362644 NP_001362645 NP_001362647 NP_001362649 |
| NP_001075429 NP_001107819 NP_001273528 NP_001273529 NP_001273530
| NP_001273531 NP_001273532 NP_083909 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 33.5 – 33.72 Mb | Хр. 9: 113.74 – 113.92 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CLASP2 (англ. Cytoplasmic linker associated protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 294 амінокислот, а молекулярна маса — 141 133[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAMGDDKSFD | | DEESVDGNRP | | SSAASAFKVP | | APKTSGNPAN | | SARKPGSAGG |
PKVGGASKEG | | GAGAVDEDDF | | IKAFTDVPSI | | QIYSSRELEE | | TLNKIREILS |
DDKHDWDQRA | | NALKKIRSLL | | VAGAAQYDCF | | FQHLRLLDGA | | LKLSAKDLRS |
QVVREACITV | | AHLSTVLGNK | | FDHGAEAIVP | | TLFNLVPNSA | | KVMATSGCAA |
IRFIIRHTHV | | PRLIPLITSN | | CTSKSVPVRR | | RSFEFLDLLL | | QEWQTHSLER |
HAAVLVETIK | | KGIHDADAEA | | RVEARKTYMG | | LRNHFPGEAE | | TLYNSLEPSY |
QKSLQTYLKS | | SGSVASLPQS | | DRSSSSSQES | | LNRPFSSKWS | | TANPSTVAGR |
VSAGSSKASS | | LPGSLQRSRS | | DIDVNAAAGA | | KAHHAAGQSV | | RRGRLGAGAL |
NAGSYASLED | | TSDKLDGTAS | | EDGRVRAKLS | | APLAGMGNAK | | ADSRGRSRTK |
MVSQSQPGSR | | SGSPGRVLTT | | TALSTVSSGV | | QRVLVNSASA | | QKRSKIPRSQ |
GCSREASPSR | | LSVARSSRIP | | RPSVSQGCSR | | EASRESSRDT | | SPVRSFQPLA |
SRHHSRSTGA | | LYAPEVYGAS | | GPGYGISQSS | | RLSSSVSAMR | | VLNTGSDVEE |
AVADALKKPA | | RRRYESYGMH | | SDDDANSDAS | | SACSERSYSS | | RNGSIPTYMR |
QTEDVAEVLN | | RCASSNWSER | | KEGLLGLQNL | | LKNQRTLSRV | | ELKRLCEIFT |
RMFADPHGKR | | VFSMFLETLV | | DFIQVHKDDL | | QDWLFVLLTQ | | LLKKMGADLL |
GSVQAKVQKA | | LDVTRESFPN | | DLQFNILMRF | | TVDQTQTPSL | | KVKVAILKYI |
ETLAKQMDPG | | DFINSSETRL | | AVSRVITWTT | | EPKSSDVRKA | | AQSVLISLFE |
LNTPEFTMLL | | GALPKTFQDG | | ATKLLHNHLR | | NTGNGTQSSM | | GSPLTRPTPR |
SPANWSSPLT | | SPTNTSQNTL | | SPSAFDYDTE | | NMNSEDIYSS | | LRGVTEAIQN |
FSFRSQEDMN | | EPLKRDSKKD | | DGDSMCGGPG | | MSDPRAGGDA | | TDSSQTALDN |
KASLLHSMPT | | HSSPRSRDYN | | PYNYSDSISP | | FNKSALKEAM | | FDDDADQFPD |
DLSLDHSDLV | | AELLKELSNH | | NERVEERKIA | | LYELMKLTQE | | ESFSVWDEHF |
KTILLLLLET | | LGDKEPTIRA | | LALKVLREIL | | RHQPARFKNY | | AELTVMKTLE |
AHKDPHKEVV | | RSAEEAASVL | | ATSISPEQCI | | KVLCPIIQTA | | DYPINLAAIK |
MQTKVIERVS | | KETLNLLLPE | | IMPGLIQGYD | | NSESSVRKAC | | VFCLVAVHAV |
IGDELKPHLS | | QLTGSKMKLL | | NLYIKRAQTG | | SGGADPTTDV | | SGQS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках, хромосомах, центромерах, апараті гольджі, кінетохорі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wittmann T., Waterman-Storer C.M. (2005). Spatial regulation of CLASP affinity for microtubules by Rac1 and GSK3beta in migrating epithelial cells. J. Cell Biol. 169: 929—939. PMID 15955847 DOI:10.1083/jcb.200412114
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
- Zaoui K., Benseddik K., Daou P., Salaun D., Badache A. (2010). ErbB2 receptor controls microtubule capture by recruiting ACF7 to the plasma membrane of migrating cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 18517—18522. PMID 20937854 DOI:10.1073/pnas.1000975107
- Maki T., Grimaldi A.D., Fuchigami S., Kaverina I., Hayashi I. (2015). CLASP2 has two distinct TOG domains that contribute differently to microtubule dynamics. J. Mol. Biol. 427: 2379—2395. PMID 26003921 DOI:10.1016/j.jmb.2015.05.012
- Wittmann T., Waterman-Storer C.M. (2005). J. Cell Biol. 171: 393—393.
{{cite journal}}
: Пропущений або порожній |title=
(довідка)
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17078 (англ.) . Архів оригіналу за 20 червня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O75122 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |