CHMP2B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2JQK

Ідентифікатори

Символи

CHMP2B, ALS17, CHMP2.5, DMT1, VPS2-2, VPS2B, charged multivesicular body protein 2B, FTDALS7

Зовнішні ІД

OMIM: 609512 MGI: 1916192 HomoloGene: 8534 GeneCards: CHMP2B

Пов'язані генетичні захворювання

amyotrophic lateral sclerosis type 17^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ESCRT III complex • гіалоплазма • ендосома • late endosome • late endosome membrane • мембрана • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • лізосома • екзосома • multivesicular body • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• regulation of centrosome duplication • когнітивність • nucleus organization • GO:0019067 viral life cycle • neuron cellular homeostasis • multivesicular body assembly • regulation of mitotic spindle assembly • endosome organization • автофагія • endosomal transport • protein transport • septum digestion after cytokinesis • mitotic metaphase plate congression • vacuolar transport • ESCRT III complex disassembly • macroautophagy • multivesicular body-lysosome fusion • GO:0015915 транспорт • viral budding via host ESCRT complex • endosome transport via multivesicular body sorting pathway • late endosome to vacuole transport • midbody abscission • regulation of modification of postsynaptic structure • regulation of postsynapse organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


25978


68942

Ensembl


ENSG00000083937


ENSMUSG00000004843

UniProt


Q9UQN3


Q8BJF9

RefSeq (мРНК)


NM_001244644 NM_014043


NM_026879

RefSeq (білок)


NP_001231573 NP_054762


NP_081155

Локус (UCSC)

Хр. 3: 87.23 – 87.26 Mb

Хр. 16: 65.34 – 65.36 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CHMP2B (англ. Charged multivesicular body protein 2B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 213 амінокислот, а молекулярна маса — 23 907^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASLFKKKTV	DDVIKEQNRE	LRGTQRAIIR	DRAALEKQEK	QLELEIKKMA
KIGNKEACKV	LAKQLVHLRK	QKTRTFAVSS	KVTSMSTQTK	VMNSQMKMAG
AMSTTAKTMQ	AVNKKMDPQK	TLQTMQNFQK	ENMKMEMTEE	MINDTLDDIF
DGSDDEEESQ	DIVNQVLDEI	GIEISGKMAK	APSAARSLPS	ASTSKATISD
EEIERQLKAL	GVD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін

V: Валін

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 152845—152845. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CHMP2B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24537 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UQN3 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.