CDY1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CDY1, CDY, CDY1A, chromodomain protein, Y-linked, 1, chromodomain Y-linked 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 400016 HomoloGene: 36165 GeneCards: CDY1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • histone acetyltransferase activity • methylated histone binding • transferase activity • acyltransferase activity • каталітична активність • GO:0001106 transcription corepressor activity |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • histone acetylation • обмін речовин • Сперматогенез • negative regulation of nucleic acid-templated transcription |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. Y: 25.62 – 25.62 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | н/д |
---|
Вікідані |
|
CDY1 (англ. Chromodomain Y-linked 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на Y-хромосомі.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 60 473[3].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASQEFEVEA | | IVDKRQDKNG | | NTQYLVRWKG | | YDKQDDTWEP | | EQHLMNCEKC |
VHDFNRRQTE | | KQKKLTWTTT | | SRIFSNNARR | | RTSRSTKANY | | SKNSPKTPVT |
DKHHRSKNRK | | LFAASKNVRR | | KAASILSDTK | | NMEIINSTIE | | TLAPDSPFDH |
KTVSGFQKLE | | KLDPIAADQQ | | DTVVFKVTEG | | KLLRDPLSRP | | GAEQTGIQNK |
TQIHPLMSQM | | SGSVTASMAT | | GSATRKGIVV | | LIDPLAANGT | | TDMHTSVPRV |
KGGQRNITDD | | SRDQPFIKKM | | HFTIRLTESA | | STYRDIVVKK | | EDGFTQIVLS |
TRSTEKNALN | | TEVIKEIVNA | | LNSAAADDSK | | LVLFSAAGSV | | FCCGLDFGYF |
VKHLRNNRNT | | ASLEMVDTIK | | NFVNTFIQFK | | KPIVVSVNGP | | AIGLGASILP |
LCDLVWANEK | | AWFQTPYTTF | | GQSPDGCSSI | | TFPKMMGKAS | | ANEMLIAGRK |
LTAREACAKG | | LVSQVFLTGT | | FTQEVMIQIK | | ELASYNPIVL | | EECKALVRCN |
IKLELEQANE | | RECEVLRKIW | | SSAQGIESML | | KYVENKIDEF |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ацилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Lahn B.T., Page D.C. (1997). Functional coherence of the human Y chromosome. Science. 278: 675—680. PMID 9381176 DOI:10.1126/science.278.5338.675
- Lahn B.T., Page D.C. (1999). Retroposition of autosomal mRNA yielded testis-specific gene family on human Y chromosome. Nat. Genet. 21: 429—433. PMID 10192397 DOI:10.1038/7771
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Fischle W., Franz H., Jacobs S.A., Allis C.D., Khorasanizadeh S. (2008). Specificity of the chromodomain Y chromosome family of chromodomains for lysine-methylated ARK(S/T) motifs. J. Biol. Chem. 283: 19626—19635. PMID 18450745 DOI:10.1074/jbc.M802655200
- Wu H., Min J., Antoshenko T., Plotnikov A.N. (2009). Crystal structures of human CDY proteins reveal a crotonase-like fold. Proteins. 76: 1054—1061. PMID 19507244 DOI:10.1002/prot.22472
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1809 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9Y6F8 (англ.) . Архів оригіналу за 1 січня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |