CDHR5

Ідентифікатори

Символи

CDHR5, MU-PCDH, MUCDHL, MUPCDH, MLPCDH, cadherin related family member 5

Зовнішні ІД

OMIM: 606839 MGI: 1919290 HomoloGene: 69345 GeneCards: CDHR5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • beta-catenin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cell adhesion molecule binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • spanning component of plasma membrane • brush border membrane • clathrin-coated pit • клітинна мембрана • екзосома • мембрана • cell projection • microvillus membrane • apical plasma membrane
Біологічний процес	• адгезія клітин • regulation of microvillus length • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • intermicrovillar adhesion • диференціація клітин
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


53841


72040

Ensembl


ENSG00000099834 ENSG00000273572


ENSMUSG00000025497

UniProt


Q9HBB8


Q8VHF2

RefSeq (мРНК)


NM_001171968 NM_017717 NM_021924 NM_031264 NM_031265


NM_001114322 NM_028069

RefSeq (білок)


NP_001165439 NP_068743 NP_112554


NP_001107794 NP_082345

Локус (UCSC)

Хр. 11: 0.62 – 0.63 Mb

Хр. 7: 140.85 – 140.86 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDHR5 (англ. Cadherin related family member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 845 амінокислот, а молекулярна маса — 88 223^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSWALLWPP	LLFTGLLVRP	PGTMAQAQYC	SVNKDIFEVE	ENTNVTEPLV
DIHVPEGQEV	TLGALSTPFA	FRIQGNQLFL	NVTPDYEEKS	LLEAQLLCQS
GGTLVTQLRV	FVSVLDVNDN	APEFPFKTKE	IRVEEDTKVN	STVIPETQLQ
AEDRDKDDIL	FYTLQEMTAG	ASDYFSLVSV	NRPALRLDRP	LDFYERPNMT
FWLLVRDTPG	ENVEPSHTAT	ATLVLNVVPA	DLRPPWFLPC	TFSDGYVCIQ
AQYHGAVPTG	HILPSPLVLR	PGPIYAEDGD	RGINQPIIYS	IFRGNVNGTF
IIHPDSGNLT	VARSVPSPMT	FLLLVKGQQA	DLARYSVTQV	TVEAVAAAGS
PPRFPQRLYR	GTVARGAGAG	VVVKDAAAPS	QPLRIQAQDP	EFSDLNSAIT
YRITNHSHFR	MEGEVVLTTT	TLAQAGAFYA	EVEAHNTVTS	GTATTVIEIQ
VSEQEPPSTD	VPPSPEAGGT	TGPWTSTTSE	VPRPPEPSQG	PSTTSSGGGT
GPHPPSGTTL	RPPTSSTPGG	PPGAENSTSH	QPATPGGDTA	QTPKPGTSQP
MPPGVGTSTS	HQPATPSGGT	AQTPEPGTSQ	PMPPSMGTST	SHQPATPGGG
TAQTPEAGTS	QPMPPGMGTS	TSHQPTTPGG	GTAQTPEPGT	SQPMPLSKST
PSSGGGPSED	KRFSVVDMAA	LGGVLGALLL	LALLGLAVLV	HKHYGPRLKC
CCGKAPEPQP	QGFDNQAFLP	DHKANWAPVP	SPTHDPKPAE	APMPAEPAPP
GPASPGGAPE	PPAAARAGGS	PTAVRSILTK	ERRPEGGYKA	VWFGEDIGTE
ADVVVLNAPT	LDVDGASDSG	SGDEGEGAGR	GGGPYDAPGG	DDSYI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

Paris M.J., Williams B.R.G. (2000). Characterization of a 500-kb contig spanning the region between c-Ha-Ras and MUC2 on chromosome 11p15.5. Genomics. 69: 196—202. PMID 11031102 DOI:10.1006/geno.2000.6339
Goldberg M., Wei M., Tycko B., Falikovich I., Warburton D. (2002). Identification and expression analysis of the human mu-protocadherin gene in fetal and adult kidneys. Am. J. Physiol. 283: F454—F463. PMID 12167596 DOI:10.1152/ajprenal.00012.2002
Crawley S.W., Weck M.L., Grega-Larson N.E., Shifrin D.A. Jr., Tyska M.J. (2016). ANKS4B is essential for intermicrovillar adhesion complex formation. Dev. Cell. 36: 190—200. PMID 26812018 DOI:10.1016/j.devcel.2015.12.022

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7521 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9HBB8 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.