CDHR5 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CDHR5, MU-PCDH, MUCDHL, MUPCDH, MLPCDH, cadherin related family member 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606839 MGI: 1919290 HomoloGene: 69345 GeneCards: CDHR5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • beta-catenin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cell adhesion molecule binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • spanning component of plasma membrane • brush border membrane • clathrin-coated pit • клітинна мембрана • екзосома • мембрана • cell projection • microvillus membrane • apical plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • адгезія клітин • regulation of microvillus length • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • intermicrovillar adhesion • диференціація клітин |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/10/PBB_GE_MUCDHL_220075_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_MUCDHL_220075_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d1/PBB_GE_MUCDHL_220074_at_fs.png/250px-PBB_GE_MUCDHL_220074_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/80/PBB_GE_MUCDHL_219796_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_MUCDHL_219796_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000099834 ENSG00000273572 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001171968 NM_017717 NM_021924 NM_031264 NM_031265 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001165439 NP_068743 NP_112554 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 0.62 – 0.63 Mb | Хр. 7: 140.85 – 140.86 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CDHR5 (англ. Cadherin related family member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 845 амінокислот, а молекулярна маса — 88 223[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGSWALLWPP | | LLFTGLLVRP | | PGTMAQAQYC | | SVNKDIFEVE | | ENTNVTEPLV |
DIHVPEGQEV | | TLGALSTPFA | | FRIQGNQLFL | | NVTPDYEEKS | | LLEAQLLCQS |
GGTLVTQLRV | | FVSVLDVNDN | | APEFPFKTKE | | IRVEEDTKVN | | STVIPETQLQ |
AEDRDKDDIL | | FYTLQEMTAG | | ASDYFSLVSV | | NRPALRLDRP | | LDFYERPNMT |
FWLLVRDTPG | | ENVEPSHTAT | | ATLVLNVVPA | | DLRPPWFLPC | | TFSDGYVCIQ |
AQYHGAVPTG | | HILPSPLVLR | | PGPIYAEDGD | | RGINQPIIYS | | IFRGNVNGTF |
IIHPDSGNLT | | VARSVPSPMT | | FLLLVKGQQA | | DLARYSVTQV | | TVEAVAAAGS |
PPRFPQRLYR | | GTVARGAGAG | | VVVKDAAAPS | | QPLRIQAQDP | | EFSDLNSAIT |
YRITNHSHFR | | MEGEVVLTTT | | TLAQAGAFYA | | EVEAHNTVTS | | GTATTVIEIQ |
VSEQEPPSTD | | VPPSPEAGGT | | TGPWTSTTSE | | VPRPPEPSQG | | PSTTSSGGGT |
GPHPPSGTTL | | RPPTSSTPGG | | PPGAENSTSH | | QPATPGGDTA | | QTPKPGTSQP |
MPPGVGTSTS | | HQPATPSGGT | | AQTPEPGTSQ | | PMPPSMGTST | | SHQPATPGGG |
TAQTPEAGTS | | QPMPPGMGTS | | TSHQPTTPGG | | GTAQTPEPGT | | SQPMPLSKST |
PSSGGGPSED | | KRFSVVDMAA | | LGGVLGALLL | | LALLGLAVLV | | HKHYGPRLKC |
CCGKAPEPQP | | QGFDNQAFLP | | DHKANWAPVP | | SPTHDPKPAE | | APMPAEPAPP |
GPASPGGAPE | | PPAAARAGGS | | PTAVRSILTK | | ERRPEGGYKA | | VWFGEDIGTE |
ADVVVLNAPT | | LDVDGASDSG | | SGDEGEGAGR | | GGGPYDAPGG | | DDSYI |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.
Література
- Paris M.J., Williams B.R.G. (2000). Characterization of a 500-kb contig spanning the region between c-Ha-Ras and MUC2 on chromosome 11p15.5. Genomics. 69: 196—202. PMID 11031102 DOI:10.1006/geno.2000.6339
- Goldberg M., Wei M., Tycko B., Falikovich I., Warburton D. (2002). Identification and expression analysis of the human mu-protocadherin gene in fetal and adult kidneys. Am. J. Physiol. 283: F454—F463. PMID 12167596 DOI:10.1152/ajprenal.00012.2002
- Crawley S.W., Weck M.L., Grega-Larson N.E., Shifrin D.A. Jr., Tyska M.J. (2016). ANKS4B is essential for intermicrovillar adhesion complex formation. Dev. Cell. 36: 190—200. PMID 26812018 DOI:10.1016/j.devcel.2015.12.022
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7521 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9HBB8 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |