CCL5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1B3A, 1EQT, 1HRJ, 1RTN, 1RTO, 1U4L, 1U4M, 1U4P, 1U4R, 2L9H, 2VXW, 5CMD, 5DNF, 5COY

Ідентифікатори

Символи

CCL5, D17S136E, RANTES, SCYA5, SIS-delta, SISd, TCP228, eoCP, C-C motif chemokine ligand 5

Зовнішні ІД

OMIM: 187011 MGI: 98262 HomoloGene: 2244 GeneCards: CCL5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• CCR5 chemokine receptor binding • receptor signaling protein tyrosine kinase activator activity • chemokine activity • protein self-association • CCR4 chemokine receptor binding • phosphatidylinositol phospholipase C activity • protein kinase activity • cytokine activity • CCR1 chemokine receptor binding • phospholipase activator activity • chemokine receptor binding • protein homodimerization activity • chemokine receptor antagonist activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chemoattractant activity • identical protein binding • CCR chemokine receptor binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• leukocyte cell-cell adhesion • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin • regulation of T cell activation • positive regulation of smooth muscle cell migration • activation of phospholipase D activity • negative regulation of viral genome replication • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of innate immune response • cellular response to interferon-gamma • positive regulation of macrophage chemotaxis • calcium ion transport • екзоцитоз • positive regulation of calcium ion transport • response to cytokine • regulation of insulin secretion • chemokine-mediated signaling pathway • positive regulation of cellular biosynthetic process • response to virus • positive regulation of monocyte chemotaxis • cellular response to fibroblast growth factor stimulus • neutrophil chemotaxis • response to tumor necrosis factor • negative regulation of T cell apoptotic process • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • negative regulation of macrophage apoptotic process • positive regulation of T cell proliferation • positive regulation of phosphorylation • inflammatory response • positive regulation of translational initiation • response to toxic substance • positive regulation of epithelial cell proliferation • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • cellular calcium ion homeostasis • protein tetramerization • хемотаксис • positive regulation of homotypic cell-cell adhesion • cellular response to interleukin-1 • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of viral genome replication • positive regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • positive regulation of T cell migration • regulation of chronic inflammatory response • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • neutrophil activation • protein kinase B signaling • positive regulation of cell migration • positive regulation of natural killer cell chemotaxis • cell-cell signaling • eosinophil chemotaxis • dendritic cell chemotaxis • MAPK cascade • macrophage chemotaxis • positive regulation of T cell chemotaxis • regulation of neuron death • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • negative regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway • positive regulation of T cell apoptotic process • positive regulation of cell adhesion • negative regulation of chemokine-mediated signaling pathway • monocyte chemotaxis • positive chemotaxis • positive regulation of protein tyrosine kinase activity • cellular response to tumor necrosis factor • positive regulation of activation of Janus kinase activity • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • cytokine-mediated signaling pathway • lymphocyte chemotaxis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6352


20304

Ensembl


ENSG00000271503 ENSG00000274233


ENSMUSG00000035042

UniProt


P13501


P30882

RefSeq (мРНК)


NM_002985 NM_001278736


NM_013653

RefSeq (білок)


NP_001265665 NP_002976


NP_038681

Локус (UCSC)

Хр. 17: 35.87 – 35.88 Mb

Хр. 11: 83.42 – 83.42 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CCL5 (англ. C-C motif chemokine ligand 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 91 амінокислот, а молекулярна маса — 9 990^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKVSAAALAV		ILIATALCAP		ASASPYSSDT		TPCCFAYIAR		PLPRAHIKEY
FYTSGKCSNP		AVVFVTRKNR		QVCANPEKKW		VREYINSLEM		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, хемотаксис. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kameyoshi Y., Doerschner A., Mallet A.I., Christophers E., Schroeder J.-M. (1992). Cytokine RANTES released by thrombin-stimulated platelets is a potent attractant for human eosinophils. J. Exp. Med. 176: 587—592. PMID 1380064 DOI:10.1084/jem.176.2.587
Lim J.K., Burns J.M., Lu W., DeVico A.L. (2005). Multiple pathways of amino terminal processing produce two truncated variants of RANTES/CCL5. J. Leukoc. Biol. 78: 442—452. PMID 15923218 DOI:10.1189/jlb.0305161
Ignatov A., Robert J., Gregory-Evans C., Schaller H.C. (2006). RANTES stimulates Ca2+ mobilization and inositol trisphosphate (IP3) formation in cells transfected with G protein-coupled receptor 75. Br. J. Pharmacol. 149: 490—497. PMID 17001303 DOI:10.1038/sj.bjp.0706909
Skelton N.J., Aspiras F., Ogez J., Schall T.J. (1995). Proton NMR assignments and solution conformation of RANTES, a chemokine of the C-C type. Biochemistry. 34: 5329—5342. PMID 7537088 DOI:10.1021/bi00016a004
Chung C.-W., Cooke R.M., Proudfoot A.E.I., Wells T.N.C. (1995). The three-dimensional solution structure of RANTES. Biochemistry. 34: 9307—9314. PMID 7542919 DOI:10.1021/bi00029a005

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10632 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P13501 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.