CCL13 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CCL13

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2RA4

Ідентифікатори

Символи

CCL13, CKb10, MCP-4, NCC-1, NCC1, SCYA13, SCYL1, C-C motif chemokine ligand 13

Зовнішні ІД

OMIM: 601391 HomoloGene: 2241 GeneCards: CCL13

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity • chemokine activity • CCR chemokine receptor binding • signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• monocyte chemotaxis • cell-cell signaling • eosinophil chemotaxis • хемотаксис • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • cytoskeleton organization • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • regulation of cell shape • GO:0072468 сигнальна трансдукція • inflammatory response • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • cellular calcium ion homeostasis • neutrophil chemotaxis • lymphocyte chemotaxis • chemokine-mediated signaling pathway • cellular response to interferon-gamma • cellular response to interleukin-1 • cellular response to tumor necrosis factor • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • cell chemotaxis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6357


24770

Ensembl


ENSG00000181374


ENSRNOG00000007159

UniProt


Q99616


P14844

RefSeq (мРНК)


NM_005408


NM_031530

RefSeq (білок)


NP_005399


NP_113718

Локус (UCSC)

Хр. 17: 34.36 – 34.36 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CCL13 (англ. C-C motif chemokine ligand 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 98 амінокислот, а молекулярна маса — 10 986^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKVSAVLLCL		LLMTAAFNPQ		GLAQPDALNV		PSTCCFTFSS		KKISLQRLKS
YVITTSRCPQ		KAVIFRTKLG		KEICADPKEK		WVQNYMKHLG		RKAHTLKT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, хемотаксис. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Barinka C., Prahl A., Lubkowski J. (2008). Structure of human monocyte chemoattractant protein 4 (MCP-4/CCL13). Acta Crystallogr. D. 64: 273—278. PMID 18323622 DOI:10.1107/S0907444907066164
Power C.A., Meyer A., Rison S.C.G., Guye-Coulin F., Wells T.N.C. (1996). Cloning and characterization of MCP-4, a novel CC chemokine related to MCP-1 and eotaxin. Eur. Cytokine Netw. 7: 513—513.

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10611 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, Q99616 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.