CBX5 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3FDT, 3I3C | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CBX5, HEL25, HP1, HP1A, chromobox 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604478 MGI: 109372 HomoloGene: 7257 GeneCards: CBX5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein-macromolecule adaptor activity • chromatin binding • histone deacetylase binding • methylated histone binding • ribonucleoprotein complex binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • кінетохор • клітинне ядро • nuclear envelope • pericentric heterochromatin • ядерце • histone deacetylase complex • нуклеоплазма • chromocenter • GO:0035328 Гетерохроматин • центромера • histone methyltransferase complex • transcription repressor complex • хромосома • PML body • GO:0009327 protein-containing complex • Рибонуклеопротеїни • site of DNA damage |
---|
Біологічний процес | • зсідання крові • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0022415 viral process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of G0 to G1 transition • cellular response to DNA damage stimulus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_012117 NM_001127321 NM_001127322 |
| | NM_001076789 NM_001110216 NM_007626 NM_001358950 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001120793 NP_001120794 NP_036249 |
| | NP_001070257 NP_001103686 NP_031652 NP_001345879 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 54.23 – 54.28 Mb | Хр. 15: 103.1 – 103.15 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CBX5 (англ. Chromobox 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 191 амінокислот, а молекулярна маса — 22 225[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGKKTKRTAD | | SSSSEDEEEY | | VVEKVLDRRV | | VKGQVEYLLK | | WKGFSEEHNT |
WEPEKNLDCP | | ELISEFMKKY | | KKMKEGENNK | | PREKSESNKR | | KSNFSNSADD |
IKSKKKREQS | | NDIARGFERG | | LEPEKIIGAT | | DSCGDLMFLM | | KWKDTDEADL |
VLAKEANVKC | | PQIVIAFYEE | | RLTWHAYPED | | AENKEKETAK | | S |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ye Q., Worman H.J. (1996). Interaction between an integral protein of the nuclear envelope inner membrane and human chromodomain proteins homologous to Drosophila HP1. J. Biol. Chem. 271: 14653—14656. PMID 8663349 DOI:10.1074/jbc.271.25.14653
- Ye Q., Callebaut I., Pezhman A., Courvalin J.-C., Worman H.J. (1997). Domain-specific interactions of human HP1-type chromodomain proteins and inner nuclear membrane protein LBR. J. Biol. Chem. 272: 14983—14989. PMID 9169472 DOI:10.1074/jbc.272.23.14983
- Minc E., Allory Y., Worman H.J., Courvalin J.-C., Buendia B. (1999). Localization and phosphorylation of HP1 proteins during the cell cycle in mammalian cells. Chromosoma. 108: 220—234. PMID 10460410 DOI:10.1007/s004120050372
- Lachner M., O'Carroll D., Rea S., Mechtler K., Jenuwein T. (2001). Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins. Nature. 410: 116—120. PMID 11242053 DOI:10.1038/35065132
- Lechner M.S., Schultz D.C., Negorev D., Maul G.G., Rauscher F.J. III (2005). The mammalian heterochromatin protein 1 binds diverse nuclear proteins through a common motif that targets the chromoshadow domain. Biochem. Biophys. Res. Commun. 331: 929—937. PMID 15882967 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.04.016
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1555 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P45973 (англ.) . Архів оригіналу за 30 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |