CAPN8 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CAPN8

Ідентифікатори

Символи

CAPN8, nCL-2, calpain 8

Зовнішні ІД

MGI: 2181366 HomoloGene: 15643 GeneCards: CAPN8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • cysteine-type peptidase activity • зв'язування з іоном металу • calcium ion binding • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинний • цитоплазма
Біологічний процес	• протеоліз • травлення
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


388743


170725

Ensembl


ENSG00000203697


ENSMUSG00000038599

UniProt


A6NHC0 A3QK37


Q91VA3

RefSeq (мРНК)


NM_001143962


NM_001145806 NM_130890

RefSeq (білок)


NP_001137434


NP_001139278 NP_570960

Локус (UCSC)

Хр. 1: 223.54 – 223.67 Mb

Хр. 1: 182.39 – 182.46 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CAPN8 (англ. Calpain 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 703 амінокислот, а молекулярна маса — 79 144^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAQAAGVSR	QRAATQGLGS	NQNALKYLGQ	DFKTLRQQCL	DSGVLFKDPE
FPACPSALGY	KDLGPGSPQT	QGIIWKRPTE	LCPSPQFIVG	GATRTDICQG
GLGDCWLLAA	IASLTLNEEL	LYRVVPRDQD	FQENYAGIFH	FQFWQYGEWV
EVVIDDRLPT	KNGQLLFLHS	EQGNEFWSAL	LEKAYAKLNG	CYEALAGGST
VEGFEDFTGG	ISEFYDLKKP	PANLYQIIRK	ALCAGSLLGC	SIDVSSAAEA
EAITSQKLVK	SHAYSVTGVE	EVNFQGHPEK	LIRLRNPWGE	VEWSGAWSDD
APEWNHIDPR	RKEELDKKVE	DGEFWMSLSD	FVRQFSRLEI	CNLSPDSLSS
EEVHKWNLVL	FNGHWTRGST	AGGCQNYPAT	YWTNPQFKIR	LDEVDEDQEE
SIGEPCCTVL	LGLMQKNRRW	RKRIGQGMLS	IGYAVYQVPK	ELESHTDAHL
GRDFFLAYQP	SARTSTYVNL	REVSGRARLP	PGEYLVVPST	FEPFKDGEFC
LRVFSEKKAQ	ALEIGDVVAG	NPYEPHPSEV	DQEDDQFRRL	FEKLAGKDSE
ITANALKILL	NEAFSKRTDI	KFDGFNINTC	REMISLLDSN	GTGTLGAVEF
KTLWLKIQKY	LEIYWETDYN	HSGTIDAHEM	RTALRKAGFT	LNSQVQQTIA
LRYACSKLGI	NFDSFVACMI	RLETLFKLFS	LLDEDKDGMV	QLSLAEWLCC
VLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1485 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, A6NHC0 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2018. Процитовано 28 серпня 2017.