CAPN5 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CAPN5, ADNIV, HTRA3, VRNI, nCL-3, calpain 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602537 MGI: 1100859 HomoloGene: 31212 GeneCards: CAPN5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity |
---|
Клітинна компонента | • cell surface • екзосома • внутрішньоклітинний • focal adhesion • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0072468 сигнальна трансдукція • протеоліз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 77.07 – 77.13 Mb | Хр. 7: 98.12 – 98.18 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CAPN5 (англ. Calpain 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 640 амінокислот, а молекулярна маса — 73 169[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MFSCVKPYED | | QNYSALRRDC | | RRRKVLFEDP | | LFPATDDSLY | | YKGTPGPAVR |
WKRPKGICED | | PRLFVDGISS | | HDLHQGQVGN | | CWFVAACSSL | | ASRESLWQKV |
IPDWKEQEWD | | PEKPNAYAGI | | FHFHFWRFGE | | WVDVVIDDRL | | PTVNNQLIYC |
HSNSRNEFWC | | ALVEKAYAKL | | AGCYQALDGG | | NTADALVDFT | | GGVSEPIDLT |
EGDFANDETK | | RNQLFERMLK | | VHSRGGLISA | | SIKAVTAADM | | EARLACGLVK |
GHAYAVTDVR | | KVRLGHGLLA | | FFKSEKLDMI | | RLRNPWGERE | | WNGPWSDTSE |
EWQKVSKSER | | EKMGVTVQDD | | GEFWMTFEDV | | CRYFTDIIKC | | RVINTSHLSI |
HKTWEEARLH | | GAWTLHEDPR | | QNRGGGCINH | | KDTFFQNPQY | | IFEVKKPEDE |
VLICIQQRPK | | RSTRREGKGE | | NLAIGFDIYK | | VEENRQYRMH | | SLQHKAASSI |
YINSRSVFLR | | TDQPEGRYVI | | IPTTFEPGHT | | GEFLLRVFTD | | VPSNCRELRL |
DEPPHTCWSS | | LCGYPQLVTQ | | VHVLGAAGLK | | DSPTGANSYV | | IIKCEGDKVR |
SAVQKGTSTP | | EYNVKGIFYR | | KKLSQPITVQ | | VWNHRVLKDE | | FLGQVHLKAD |
PDNLQALHTL | | HLRDRNSRQP | | SNLPGTVAVH | | ILSSTSLMAV |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз.
Література
- Mugita N., Kimura Y., Ogawa M., Saya H., Nakao M. (1997). Identification of a novel, tissue-specific calpain htra-3; a human homologue of the Caenorhabditis elegans sex determination gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 239: 845—850. PMID 9367857 DOI:10.1006/bbrc.1997.7571
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Dear T.N., Matena K., Vingron M., Boehm T. (1997). A new subfamily of vertebrate calpains lacking a calmodulin-like domain: implications for calpain regulation and evolution. Genomics. 45: 175—184. PMID 9339374 DOI:10.1006/geno.1997.4870
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1482 (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O15484 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |