C4A

C4A
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1HZF, 4FXG, 4FXK, 4XAM

Ідентифікатори
Символи C4A, C4, C4A2, C4A3, C4A4, C4A6, C4AD, C4S, CO4, CPAMD2, RG, complement component 4A (Rodgers blood group), complement C4A (Rodgers blood group)
Зовнішні ІД OMIM: 120810 MGI: 88228 HomoloGene: 36030 GeneCards: C4A
Пов'язані генетичні захворювання
complement component 4a deficiency[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

endopeptidase inhibitor activity
complement component C1q complex binding
serine-type endopeptidase activity

Клітинна компонента

extracellular region
клітинна мембрана
екзосома
blood microparticle
cell projection
дендрит (нейробіологія)
міжклітинні контакти
синапс
аксон
neuronal cell body
міжклітинний простір
endoplasmic reticulum lumen

Біологічний процес

complement activation
inflammatory response
positive regulation of apoptotic cell clearance
regulation of complement activation
negative regulation of endopeptidase activity
complement activation, classical pathway
процес імунної системи
вроджений імунітет
протеоліз
посттрансляційна модифікація

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
720
12268
Ensembl
ENSG00000244207
ENSG00000206340
ENSG00000244731
ENSG00000227746
ENSMUSG00000073418
UniProt
P0C0L4
P01029
RefSeq (мРНК)
NM_001252204
NM_007293
NM_009780
RefSeq (білок)
NP_001239133
NP_009224
NP_033910
Локус (UCSC) Хр. 6: 31.98 – 32 Mb Хр. 17: 34.95 – 34.96 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

C4A (англ. Complement C4A (Rodgers blood group)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 744 амінокислот, а молекулярна маса — 192 785[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRLLWGLIWASSFFTLSLQKPRLLLFSPSVVHLGVPLSVGVQLQDVPRGQ
VVKGSVFLRNPSRNNVPCSPKVDFTLSSERDFALLSLQVPLKDAKSCGLH
QLLRGPEVQLVAHSPWLKDSLSRTTNIQGINLLFSSRRGHLFLQTDQPIY
NPGQRVRYRVFALDQKMRPSTDTITVMVENSHGLRVRKKEVYMPSSIFQD
DFVIPDISEPGTWKISARFSDGLESNSSTQFEVKKYVLPNFEVKITPGKP
YILTVPGHLDEMQLDIQARYIYGKPVQGVAYVRFGLLDEDGKKTFFRGLE
SQTKLVNGQSHISLSKAEFQDALEKLNMGITDLQGLRLYVAAAIIESPGG
EMEEAELTSWYFVSSPFSLDLSKTKRHLVPGAPFLLQALVREMSGSPASG
IPVKVSATVSSPGSVPEVQDIQQNTDGSGQVSIPIIIPQTISELQLSVSA
GSPHPAIARLTVAAPPSGGPGFLSIERPDSRPPRVGDTLNLNLRAVGSGA
TFSHYYYMILSRGQIVFMNREPKRTLTSVSVFVDHHLAPSFYFVAFYYHG
DHPVANSLRVDVQAGACEGKLELSVDGAKQYRNGESVKLHLETDSLALVA
LGALDTALYAAGSKSHKPLNMGKVFEAMNSYDLGCGPGGGDSALQVFQAA
GLAFSDGDQWTLSRKRLSCPKEKTTRKKRNVNFQKAINEKLGQYASPTAK
RCCQDGVTRLPMMRSCEQRAARVQQPDCREPFLSCCQFAESLRKKSRDKG
QAGLQRALEILQEEDLIDEDDIPVRSFFPENWLWRVETVDRFQILTLWLP
DSLTTWEIHGLSLSKTKGLCVATPVQLRVFREFHLHLRLPMSVRRFEQLE
LRPVLYNYLDKNLTVSVHVSPVEGLCLAGGGGLAQQVLVPAGSARPVAFS
VVPTAAAAVSLKVVARGSFEFPVGDAVSKVLQIEKEGAIHREELVYELNP
LDHRGRTLEIPGNSDPNMIPDGDFNSYVRVTASDPLDTLGSEGALSPGGV
ASLLRLPRGCGEQTMIYLAPTLAASRYLDKTEQWSTLPPETKDHAVDLIQ
KGYMRIQQFRKADGSYAAWLSRDSSTWLTAFVLKVLSLAQEQVGGSPEKL
QETSNWLLSQQQADGSFQDPCPVLDRSMQGGLVGNDETVALTAFVTIALH
HGLAVFQDEGAEPLKQRVEASISKANSFLGEKASAGLLGAHAAAITAYAL
TLTKAPVDLLGVAHNNLMAMAQETGDNLYWGSVTGSQSNAVSPTPAPRNP
SDPMPQAPALWIETTAYALLHLLLHEGKAEMADQASAWLTRQGSFQGGFR
STQDTVIALDALSAYWIASHTTEERGLNVTLSSTGRNGFKSHALQLNNRQ
IRGLEEELQFSLGSKINVKVGGNSKGTLKVLRTYNVLDMKNTTCQDLQIE
VTVKGHVEYTMEANEDYEDYEYDELPAKDDPDAPLQPVTPLQLFEGRRNR
RRREAPKVVEEQESRVHYTVCIWRNGKVGLSGMAIADVTLLSGFHALRAD
LEKLTSLSDRYVSHFETEGPHVLLYFDSVPTSRECVGFEAVQEVPVGLVQ
PASATLYDYYNPERRCSVFYGAPSKSRLLATLCSAEVCQCAEGKCPRQRR
ALERGLQDEDGYRMKFACYYPRVEYGFQVKVLREDSRAAFRLFETKITQV
LHFTKDVKAAANQMRNFLVRASCRLRLEPGKEYLIMGLDGATYDLEGHPQ
YLLDSNSWIEEMPSERLCRSTRQRAACAQLNDFLQEYGTQGCQV

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, шлях активації комплементу, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах. Також секретований назовні.

Література

  • Belt K.T., Carroll M.C., Porter R.R. (1984). The structural basis of the multiple forms of human complement component C4. Cell. 36: 907—914. PMID 6546707 DOI:10.1016/0092-8674(84)90040-0
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Belt K.T., Yu C.Y., Carroll M.C., Porter R.R. (1985). Polymorphism of human complement component C4. Immunogenetics. 21: 173—180. PMID 3838531 DOI:10.1007/BF00364869
  • Hessing M., van 't Veer C., Hackeng T.M., Bouma B.N., Iwanaga S. (1990). Importance of the alpha 3-fragment of complement C4 for the binding with C4b-binding protein. FEBS Lett. 271: 131—136. PMID 1699796 DOI:10.1016/0014-5793(90)80389-Z
  • Campbell R.D., Gagnon J., Porter R.R. (1981). Amino acid sequence around the thiol and reactive acyl groups of human complement component C4. Biochem. J. 199: 359—370. PMID 6978711 DOI:10.1042/bj1990359
  • Chakravarti D.N., Campbell R.D., Porter R.R. (1987). The chemical structure of the C4d fragment of the human complement component C4. Mol. Immunol. 24: 1187—1197. PMID 3696167 DOI:10.1016/0161-5890(87)90165-9

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з C4A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1323 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, P0C0L4 (англ.) . Архів оригіналу за 9 березня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»