BIRC2

BIRC2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1QBH, 2L9M, 3D9T, 3D9U, 3M1D, 3MUP, 3OZ1, 3T6P, 3UW4, 4EB9, 4HY4, 4HY5, 4KMN, 4LGE, 4LGU, 4MTI, 4MU7

Ідентифікатори
Символи BIRC2, API1, HIAP2, Hiap-2, MIHB, RNF48, c-IAP1, cIAP1, baculoviral IAP repeat containing 2
Зовнішні ІД OMIM: 601712 MGI: 1197009 HomoloGene: 900 GeneCards: BIRC2
Онтологія гена
Молекулярна функція

• protein N-terminus binding
• зв'язування з іоном металу
• cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• transferase activity
• ubiquitin binding
• chaperone binding
• FBXO family protein binding
• zinc ion binding
• GO:0001105 transcription coactivator activity
• GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity
• identical protein binding
• GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity

Клітинна компонента

• гіалоплазма
• XY body
• membrane raft
• CD40 receptor complex
• cytoplasmic side of plasma membrane
• клітинне ядро
• цитоплазма
• GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

• regulation of apoptotic process
• regulation of nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway
• positive regulation of protein K63-linked ubiquitination
• response to hypoxia
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• regulation of innate immune response
• GO:1904578 response to organic cyclic compound
• negative regulation of ripoptosome assembly involved in necroptotic process
• inhibition of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
• placenta development
• regulation of cysteine-type endopeptidase activity
• regulation of RIG-I signaling pathway
• regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
• tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
• GO:1904489 regulation of reactive oxygen species metabolic process
• transcription, DNA-templated
• positive regulation of protein monoubiquitination
• mitotic spindle assembly
• cell surface receptor signaling pathway
• NIK/NF-kappaB signaling
• regulation of cell population proliferation
• response to organonitrogen compound
• positive regulation of protein K48-linked ubiquitination
• response to cAMP
• response to ethanol
• I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
• GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз
• GO:0097285 апоптоз
• protein deubiquitination
• cellular response to tumor necrosis factor
• regulation of NIK/NF-kappaB signaling
• positive regulation of protein polyubiquitination
• negative regulation of necroptotic process
• protein polyubiquitination
• regulation of toll-like receptor signaling pathway
• negative regulation of apoptotic process
• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• регуляція диференціювання клітин
• regulation of inflammatory response
• regulation of cell cycle
• regulation of necroptotic process
• protein heterooligomerization
• positive regulation of nucleic acid-templated transcription
• MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway
• TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway
• positive regulation of protein ubiquitination
• negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
329
11797
Ensembl
ENSG00000110330
ENSMUSG00000057367
UniProt
Q13490
Q62210
RefSeq (мРНК)
NM_001256166
NM_001166
NM_001256163
NM_007465
NM_001291503
RefSeq (білок)
NP_001157
NP_001243092
NP_001243095
NP_001278432
NP_031491
Локус (UCSC) Хр. 11: 102.35 – 102.38 Mb Хр. 9: 7.82 – 7.84 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

BIRC2 (англ. Baculoviral IAP repeat containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 618 амінокислот, а молекулярна маса — 69 900[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MHKTASQRLFPGPSYQNIKSIMEDSTILSDWTNSNKQKMKYDFSCELYRM
STYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKLGDSPI
QKHKQLYPSCSFIQNLVSASLGSTSKNTSPMRNSFAHSLSPTLEHSSLFS
GSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNPYSYAMSTEEARFLTYHMWPLTFLS
PSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEHRRHFPNCPFL
ENSLETLRFSISNLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGFYYVGR
NDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQG
RYPHLLEQLLSTSDTTGEENADPPIIHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSAL
EMGFNRDLVKQTVQSKILTTGENYKTVNDIVSALLNAEDEKREEEKEKQA
EEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILDNLLKANVINKQEHDIIKQKT
QIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTLYKNLFVDKNMKYIPT
EDVSGLSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQECAPSLR
KCPICRGIIKGTVRTFLS

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Rothe M., Pan M.-G., Henzel W.J., Ayres T.M., Goeddel D.V. (1995). The TNFR2-TRAF signaling complex contains two novel proteins related to baculoviral inhibitor of apoptosis proteins. Cell. 83: 1243—1252. PMID 8548810 DOI:10.1016/0092-8674(95)90149-3
  • Uren A.G., Pakusch M., Hawkins C.J., Puls K.L., Vaux D.L. (1996). Cloning and expression of apoptosis inhibitory protein homologs that function to inhibit apoptosis and/or bind tumor necrosis factor receptor-associated factors. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 4974—4978. PMID 8643514 DOI:10.1073/pnas.93.10.4974
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Dubrez-Daloz L., Dupoux A., Cartier J. (2008). IAPs: more than just inhibitors of apoptosis proteins. Cell Cycle. 7: 1036—1046. PMID 18414036 DOI:10.4161/cc.7.8.5783
  • Lopez J., Meier P. (2010). To fight or die - inhibitor of apoptosis proteins at the crossroad of innate immunity and death. Curr. Opin. Cell Biol. 22: 872—881. PMID 20888210 DOI:10.1016/j.ceb.2010.08.025
  • Gyrd-Hansen M., Meier P. (2010). IAPs: from caspase inhibitors to modulators of NF-kappaB, inflammation and cancer. Nat. Rev. Cancer. 10: 561—574. PMID 20651737 DOI:10.1038/nrc2889

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:590 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q13490 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»