ARHGEF4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DX1, 2PZ1, 3NMX, 3NMZ

Ідентифікатори

Символи

ARHGEF4, ASEF, ASEF1, GEF4, STM6, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, SMIM39

Зовнішні ІД

OMIM: 605216 MGI: 2442507 HomoloGene: 49414 GeneCards: ARHGEF4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • ruffle membrane • гіалоплазма • клітинна мембрана • cell projection • мембрана
Біологічний процес	• filopodium assembly • regulation of Rho protein signal transduction • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • lamellipodium assembly • positive regulation of apoptotic process • G protein-coupled receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


50649


226970

Ensembl


ENSG00000136002


ENSMUSG00000037509

UniProt


Q9NR80


Q7TNR9

RefSeq (мРНК)

NM_015320 NM_032995 NM_001367493 NM_001375900 NM_001375901
NM_001375902 NM_001375903 NM_001375904 NM_001395416


NM_183019 NM_001368773

RefSeq (білок)

NP_056135 NP_001354422 NP_001362829 NP_001362830 NP_001362831
NP_001362832 NP_001362833


NP_898840 NP_001355702

Локус (UCSC)

Хр. 2: 130.84 – 131.05 Mb

Хр. 1: 34.68 – 34.81 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ARHGEF4 (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 690 амінокислот, а молекулярна маса — 79 067^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPWEEPAGEK	PSCSHSQKAF	HMEPAQKPCF	TTDMVTWALL	CISAETVRGE
APSQPRGIPH	RSPVSVDDLW	LEKTQRKKLQ	KQAHVERRLH	IGAVHKDGVK
CWRKTIITSP	ESLNLPRRSH	PLSQSAPTGL	NHMGWPEHTP	GTAMPDGALD
TAVCADEVGS	EEDLYDDLHS	SSHHYSHPGG	GGEQLAINEL	ISDGSVVCAE
ALWDHVTMDD	QELGFKAGDV	IEVMDATNRE	WWWGRVADGE	GWFPASFVRL
RVNQDEPADD	DAPLAGNSGA	EDGGAEAQSS	KDQMRTNVIN	EILSTERDYI
KHLRDICEGY	VRQCRKRADM	FSEEQLRTIF	GNIEDIYRCQ	KAFVKALEQR
FNRERPHLSE	LGACFLEHQA	DFQIYSEYCN	NHPNACVELS	RLTKLSKYVY
FFEACRLLQK	MIDISLDGFL	LTPVQKICKY	PLQLAELLKY	THPQHRDFKD
VEAALHAMKN	VAQLINERKR	RLENIDKIAQ	WQSSIEDWEG	EDLLVRSSEL
IYSGELTRVT	QPQAKSQQRM	FFLFDHQLIY	CKKDLLRRDV	LYYKGRLDMD
GLEVVDLEDG	KDRDLHVSIK	NAFRLHRGAT	GDSHLLCTRK	PEQKQRWLKA
FAREREQVQL	DQETGFSITE	LQRKQAMLNA	SKQQVTGKPK	AVGRPCYLTR
QKHPALPSNR	PQQQVLVLAE	PRRKPSTFWH	SISRLAPFRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.

Література

Thiesen S., Kuebart S., Ropers H.-H., Nothwang H.G. (2000). Isolation of two novel human RhoGEFs, ARHGEF3 and ARHGEF4, in 3p13-21 and 2q22. Biochem. Biophys. Res. Commun. 273: 364—369. PMID 10873612 DOI:10.1006/bbrc.2000.2925
Kawasaki Y., Sato R., Akiyama T. (2003). Mutated APC and Asef are involved in the migration of colorectal tumour cells. Nat. Cell Biol. 5: 211—215. PMID 12598901 DOI:10.1038/ncb937
Hamann M.J., Lubking C.M., Luchini D.N., Billadeau D.D. (2007). Asef2 functions as a Cdc42 exchange factor and is stimulated by the release of an autoinhibitory module from a concealed C-terminal activation element. Mol. Cell. Biol. 27: 1380—1393. PMID 17145773 DOI:10.1128/MCB.01608-06

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:684 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9NR80 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2016. Процитовано 29 серпня 2017.