APOLD1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

APOLD1

Ідентифікатори

Символи

APOLD1, VERGE, apolipoprotein L domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 612456 MGI: 2685921 HomoloGene: 12781 GeneCards: APOLD1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• lipid binding
Клітинна компонента	• extracellular region • клітинна мембрана • integral component of membrane • мембрана • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• Ангіогенез • response to hypoxia • lipid transport • диференціація клітин • endothelial cell activation • lipoprotein metabolic process • regulation of endothelial cell differentiation • multicellular organism development
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


81575


381823

Ensembl


ENSG00000178878


ENSMUSG00000090698

UniProt


Q96LR9


E9Q0X2

RefSeq (мРНК)


NM_030817 NM_001130415


NM_001109914

RefSeq (білок)


NP_001123887 NP_110444


NP_001103384

Локус (UCSC)

Хр. 12: 12.73 – 12.83 Mb

Хр. 6: 134.96 – 134.96 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

APOLD1 (англ. Apolipoprotein L domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 279 амінокислот, а молекулярна маса — 30 546^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFRAPCHRLR	ARGTRKARAG	AWRGCTFPCL	GKGMERPAAR	EPHGPDALRR
FQGLLLDRRG	RLHGQVLRLR	EVARRLERLR	RRSLVANVAG	SSLSATGALA
AIVGLSLSPV	TLGTSLLVSA	VGLGVATAGG	AVTITSDLSL	IFCNSRELRR
VQEIAATCQD	QMREILSCLE	FFCRWQGCGD	RQLLQCGRNA	SIALYNSVYF
IVFFGSRGFL	IPRRAEGDTK	VSQAVLKAKI	QKLAESLESC	TGALDELSEQ
LESRVQLCTK	SSRGHDLKIS	ADQRAGLFF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як ангіогенез, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25268 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96LR9 (англ.) . Архів оригіналу за 14 листопада 2016. Процитовано 11 вересня 2017.