ANTXR1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3N2N

Ідентифікатори

Символи

ANTXR1, ATR, GAPO, TEM8, anthrax toxin receptor 1, ANTXR cell adhesion molecule 1

Зовнішні ІД

OMIM: 606410 MGI: 1916788 HomoloGene: 12976 GeneCards: ANTXR1

Пов'язані генетичні захворювання

GAPO syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin filament binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • collagen binding • transmembrane signaling receptor activity • зв'язування з іоном металу • signaling receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • cell surface • клітинна мембрана • cell projection • endosome membrane • lamellipodium membrane • екзосома • мембрана • filopodium membrane • external side of plasma membrane
Біологічний процес	• actin cytoskeleton reorganization • розмножувальний процес • substrate adhesion-dependent cell spreading • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of metallopeptidase activity • negative regulation of extracellular matrix assembly • blood vessel development • toxin transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84168


69538

Ensembl


ENSG00000169604


ENSMUSG00000033420

UniProt


Q9H6X2 Q96EC6


Q9CZ52

RefSeq (мРНК)


NM_018153 NM_032208 NM_053034


NM_054041

RefSeq (білок)


NP_060623 NP_115584 NP_444262 NP_060623.2


NP_473382

Локус (UCSC)

Хр. 2: 69.01 – 69.25 Mb

Хр. 6: 87.11 – 87.31 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ANTXR1 (англ. Anthrax toxin receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 564 амінокислот, а молекулярна маса — 62 789^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATAERRALG	IGFQWLSLAT	LVLICAGQGG	RREDGGPACY	GGFDLYFILD
KSGSVLHHWN	EIYYFVEQLA	HKFISPQLRM	SFIVFSTRGT	TLMKLTEDRE
QIRQGLEELQ	KVLPGGDTYM	HEGFERASEQ	IYYENRQGYR	TASVIIALTD
GELHEDLFFY	SEREANRSRD	LGAIVYCVGV	KDFNETQLAR	IADSKDHVFP
VNDGFQALQG	IIHSILKKSC	IEILAAEPST	ICAGESFQVV	VRGNGFRHAR
NVDRVLCSFK	INDSVTLNEK	PFSVEDTYLL	CPAPILKEVG	MKAALQVSMN
DGLSFISSSV	IITTTHCSDG	SILAIALLIL	FLLLALALLW	WFWPLCCTVI
IKEVPPPPAE	ESEEEDDDGL	PKKKWPTVDA	SYYGGRGVGG	IKRMEVRWGE
KGSTEEGAKL	EKAKNARVKM	PEQEYEFPEP	RNLNNNMRRP	SSPRKWYSPI
KGKLDALWVL	LRKGYDRVSV	MRPQPGDTGR	CINFTRVKNN	QPAKYPLNNA
YHTSSPPPAP	IYTPPPPAPH	CPPPPPSAPT	PPIPSPPSTL	PPPPQAPPPN
RAPPPSRPPP	RPSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

Bradley K.A., Mogridge J., Mourez M., Collier R.J., Young J.A.T. (2001). Identification of the cellular receptor for anthrax toxin. Nature. 414: 225—229. PMID 11700562 DOI:10.1038/n35101999
Vargas M., Karamsetty R., Leppla S.H., Chaudry G.J. (2012). Broad expression analysis of human ANTXR1/TEM8 transcripts reveals differential expression and novel splizce variants. PLoS ONE. 7: E43174—E43174. PMID 22912819 DOI:10.1371/journal.pone.0043174
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Scobie H.M., Rainey G.J.A., Bradley K.A., Young J.A.T. (2003). Human capillary morphogenesis protein 2 functions as an anthrax toxin receptor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 5170—5174. PMID 12700348 DOI:10.1073/pnas.0431098100
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Werner E., Kowalczyk A.P., Faundez V. (2006). Anthrax toxin receptor 1/tumor endothelium marker 8 mediates cell spreading by coupling extracellular ligands to the actin cytoskeleton. J. Biol. Chem. 281: 23227—23236. PMID 16762926 DOI:10.1074/jbc.M603676200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ANTXR1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21014 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9H6X2 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.