ANTXR1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ANTXR1, ATR, GAPO, TEM8, anthrax toxin receptor 1, ANTXR cell adhesion molecule 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606410 MGI: 1916788 HomoloGene: 12976 GeneCards: ANTXR1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
GAPO syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • actin filament binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • collagen binding • transmembrane signaling receptor activity • зв'язування з іоном металу • signaling receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • cell surface • клітинна мембрана • cell projection • endosome membrane • lamellipodium membrane • екзосома • мембрана • filopodium membrane • external side of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • actin cytoskeleton reorganization • розмножувальний процес • substrate adhesion-dependent cell spreading • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of metallopeptidase activity • negative regulation of extracellular matrix assembly • blood vessel development • toxin transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4a/PBB_GE_ANTXR1_220092_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_ANTXR1_220092_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_018153 NM_032208 NM_053034 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_060623 NP_115584 NP_444262 NP_060623.2 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 69.01 – 69.25 Mb | Хр. 6: 87.11 – 87.31 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ANTXR1 (англ. Anthrax toxin receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 564 амінокислот, а молекулярна маса — 62 789[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATAERRALG | | IGFQWLSLAT | | LVLICAGQGG | | RREDGGPACY | | GGFDLYFILD |
KSGSVLHHWN | | EIYYFVEQLA | | HKFISPQLRM | | SFIVFSTRGT | | TLMKLTEDRE |
QIRQGLEELQ | | KVLPGGDTYM | | HEGFERASEQ | | IYYENRQGYR | | TASVIIALTD |
GELHEDLFFY | | SEREANRSRD | | LGAIVYCVGV | | KDFNETQLAR | | IADSKDHVFP |
VNDGFQALQG | | IIHSILKKSC | | IEILAAEPST | | ICAGESFQVV | | VRGNGFRHAR |
NVDRVLCSFK | | INDSVTLNEK | | PFSVEDTYLL | | CPAPILKEVG | | MKAALQVSMN |
DGLSFISSSV | | IITTTHCSDG | | SILAIALLIL | | FLLLALALLW | | WFWPLCCTVI |
IKEVPPPPAE | | ESEEEDDDGL | | PKKKWPTVDA | | SYYGGRGVGG | | IKRMEVRWGE |
KGSTEEGAKL | | EKAKNARVKM | | PEQEYEFPEP | | RNLNNNMRRP | | SSPRKWYSPI |
KGKLDALWVL | | LRKGYDRVSV | | MRPQPGDTGR | | CINFTRVKNN | | QPAKYPLNNA |
YHTSSPPPAP | | IYTPPPPAPH | | CPPPPPSAPT | | PPIPSPPSTL | | PPPPQAPPPN |
RAPPPSRPPP | | RPSV |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.
Література
- Bradley K.A., Mogridge J., Mourez M., Collier R.J., Young J.A.T. (2001). Identification of the cellular receptor for anthrax toxin. Nature. 414: 225—229. PMID 11700562 DOI:10.1038/n35101999
- Vargas M., Karamsetty R., Leppla S.H., Chaudry G.J. (2012). Broad expression analysis of human ANTXR1/TEM8 transcripts reveals differential expression and novel splizce variants. PLoS ONE. 7: E43174—E43174. PMID 22912819 DOI:10.1371/journal.pone.0043174
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Scobie H.M., Rainey G.J.A., Bradley K.A., Young J.A.T. (2003). Human capillary morphogenesis protein 2 functions as an anthrax toxin receptor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 5170—5174. PMID 12700348 DOI:10.1073/pnas.0431098100
- Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
- Werner E., Kowalczyk A.P., Faundez V. (2006). Anthrax toxin receptor 1/tumor endothelium marker 8 mediates cell spreading by coupling extracellular ligands to the actin cytoskeleton. J. Biol. Chem. 281: 23227—23236. PMID 16762926 DOI:10.1074/jbc.M603676200
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ANTXR1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21014 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9H6X2 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |