ADAMTS12 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ADAMTS12, PRO4389, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606184 MGI: 2146046 HomoloGene: 12808 GeneCards: ADAMTS12 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
інсульт, цереброваскулярні хвороби[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • metalloendopeptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • zinc ion binding |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • regulation of endothelial tube morphogenesis • proteoglycan catabolic process • negative regulation of hepatocyte growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus • cellular response to tumor necrosis factor • cellular response to BMP stimulus • negative regulation of cellular response to hepatocyte growth factor stimulus • протеоліз • negative regulation of chondrocyte differentiation • cellular response to interleukin-1 • regulation of inflammatory response • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • cell-matrix adhesion • cell migration |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000151388 ENSG00000281690 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_030955 NM_001324511 NM_001324512 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001311440 NP_001311441 NP_112217 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 33.52 – 33.89 Mb | Хр. 15: 11.06 – 11.35 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ADAMTS12 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 594 амінокислот, а молекулярна маса — 177 676[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPCAQRSWLA | | NLSVVAQLLN | | FGALCYGRQP | | QPGPVRFPDR | | RQEHFIKGLP |
EYHVVGPVRV | | DASGHFLSYG | | LHYPITSSRR | | KRDLDGSEDW | | VYYRISHEEK |
DLFFNLTVNQ | | GFLSNSYIME | | KRYGNLSHVK | | MMASSAPLCH | | LSGTVLQQGT |
RVGTAALSAC | | HGLTGFFQLP | | HGDFFIEPVK | | KHPLVEGGYH | | PHIVYRRQKV |
PETKEPTCGL | | KDSVNISQKQ | | ELWREKWERH | | NLPSRSLSRR | | SISKERWVET |
LVVADTKMIE | | YHGSENVESY | | ILTIMNMVTG | | LFHNPSIGNA | | IHIVVVRLIL |
LEEEEQGLKI | | VHHAEKTLSS | | FCKWQKSINP | | KSDLNPVHHD | | VAVLLTRKDI |
CAGFNRPCET | | LGLSHLSGMC | | QPHRSCNINE | | DSGLPLAFTI | | AHELGHSFGI |
QHDGKENDCE | | PVGRHPYIMS | | RQLQYDPTPL | | TWSKCSEEYI | | TRFLDRGWGF |
CLDDIPKKKG | | LKSKVIAPGV | | IYDVHHQCQL | | QYGPNATFCQ | | EVENVCQTLW |
CSVKGFCRSK | | LDAAADGTQC | | GEKKWCMAGK | | CITVGKKPES | | IPGGWGRWSP |
WSHCSRTCGA | | GVQSAERLCN | | NPEPKFGGKY | | CTGERKRYRL | | CNVHPCRSEA |
PTFRQMQCSE | | FDTVPYKNEL | | YHWFPIFNPA | | HPCELYCRPI | | DGQFSEKMLD |
AVIDGTPCFE | | GGNSRNVCIN | | GICKMVGCDY | | EIDSNATEDR | | CGVCLGDGSS |
CQTVRKMFKQ | | KEGSGYVDIG | | LIPKGARDIR | | VMEIEGAGNF | | LAIRSEDPEK |
YYLNGGFIIQ | | WNGNYKLAGT | | VFQYDRKGDL | | EKLMATGPTN | | ESVWIQLLFQ |
VTNPGIKYEY | | TIQKDGLDND | | VEQQMYFWQY | | GHWTECSVTC | | GTGIRRQTAH |
CIKKGRGMVK | | ATFCDPETQP | | NGRQKKCHEK | | ACPPRWWAGE | | WEACSATCGP |
HGEKKRTVLC | | IQTMVSDEQA | | LPPTDCQHLL | | KPKTLLSCNR | | DILCPSDWTV |
GNWSECSVSC | | GGGVRIRSVT | | CAKNHDEPCD | | VTRKPNSRAL | | CGLQQCPSSR |
RVLKPNKGTI | | SNGKNPPTLK | | PVPPPTSRPR | | MLTTPTGPES | | MSTSTPAISS |
PSPTTASKEG | | DLGGKQWQDS | | STQPELSSRY | | LISTGSTSQP | | ILTSQSLSIQ |
PSEENVSSSD | | TGPTSEGGLV | | ATTTSGSGLS | | SSRNPITWPV | | TPFYNTLTKG |
PEMEIHSGSG | | EEREQPEDKD | | ESNPVIWTKI | | RVPGNDAPVE | | STEMPLAPPL |
TPDLSRESWW | | PPFSTVMEGL | | LPSQRPTTSE | | TGTPRVEGMV | | TEKPANTLLP |
LGGDHQPEPS | | GKTANRNHLK | | LPNNMNQTKS | | SEPVLTEEDA | | TSLITEGFLL |
NASNYKQLTN | | GHGSAHWIVG | | NWSECSTTCG | | LGAYWRRVEC | | STQMDSDCAA |
IQRPDPAKRC | | HLRPCAGWKV | | GNWSKCSRNC | | SGGFKIREIQ | | CVDSRDHRNL |
RPFHCQFLAG | | IPPPLSMSCN | | PEPCEAWQVE | | PWSQCSRSCG | | GGVQERGVFC |
PGGLCDWTKR | | PTSTMSCNEH | | LCCHWATGNW | | DLCSTSCGGG | | FQKRTVQCVP |
SEGNKTEDQD | | QCLCDHKPRP | | PEFKKCNQQA | | CKKSADLLCT | | KDKLSASFCQ |
TLKAMKKCSV | | PTVRAECCFS | | CPQTHITHTQ | | RQRRQRLLQK | | SKEL |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Cal S., Argueelles J.M., Fernandez P.L., Lopez-Otin C. (2001). Identification, characterization, and intracellular processing of ADAM-TS12, a novel human disintegrin with a complex structural organization involving multiple thrombospondin-1 repeats. J. Biol. Chem. 276: 17932—17940. PMID 11279086 DOI:10.1074/jbc.M100534200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ADAMTS12 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14605 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P58397 (англ.) . Архів оригіналу за 30 грудня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM | |
---|
Матриксні металопротеїнази | |
---|
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |