ABLIM1

Ідентифікатори

Символи

ABLIM1, ABLIM, LIMAB1, LIMATIN, abLIM-1, actin binding LIM protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602330 MGI: 1194500 HomoloGene: 40994 GeneCards: ABLIM1

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • actin filament binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • lamellipodium • цитоскелет • stress fiber • actin cytoskeleton
Біологічний процес	• animal organ morphogenesis • cytoskeleton organization • lamellipodium assembly • зір • cilium assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3983


226251

Ensembl


ENSG00000099204


ENSMUSG00000025085

UniProt


O14639


Q8K4G5

RefSeq (мРНК)

NM_001003407 NM_001003408 NM_002313 NM_006720 NM_001322882
NM_001322883 NM_001322884 NM_001322885 NM_001322886 NM_001322887 NM_001322888 NM_001322889 NM_001322890 NM_001322891 NM_001322892 NM_001322893 NM_001322894 NM_001322895 NM_001322896 NM_001322897 NM_001322898 NM_001322899 NM_001322900 NM_001352440 NM_001352441 NM_001352442 NM_001352443

NM_001103177 NM_001103178 NM_001290813 NM_001290815 NM_001290816
NM_178688 NM_001347459 NM_001362445 NM_001362446

RefSeq (білок)

NP_001003407 NP_001309811 NP_001309812 NP_001309813 NP_001309814
NP_001309815 NP_001309816 NP_001309817 NP_001309818 NP_001309819 NP_001309820 NP_001309821 NP_001309822 NP_001309823 NP_001309824 NP_001309825 NP_001309826 NP_001309827 NP_001309828 NP_001309829 NP_002304 NP_006711 NP_001339369 NP_001339370 NP_001339371 NP_001339372

NP_001096647 NP_001096648 NP_001277742 NP_001277744 NP_001277745
NP_001334388 NP_848803 NP_001349374 NP_001349375

Локус (UCSC)

Хр. 10: 114.43 – 114.77 Mb

Хр. 19: 57.02 – 57.3 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ABLIM1 (англ. Actin binding LIM protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 778 амінокислот, а молекулярна маса — 87 688^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPAFLGLKCL	GKLCSSEKSK	VTSSERTSAR	GSNRKRLIVE	DRRVSGTSFT
AHRRATITHL	LYLCPKDYCP	RGRVCNSVDP	FVAHPQDPHH	PSEKPVIHCH
KCGEPCKGEV	LRVQTKHFHI	KCFTCKVCGC	DLAQGGFFIK	NGEYLCTLDY
QRMYGTRCHG	CGEFVEGEVV	TALGKTYHPN	CFACTICKRP	FPPGDRVTFN
GRDCLCQLCA	QPMSSSPKET	TFSSNCAGCG	RDIKNGQALL	ALDKQWHLGC
FKCKSCGKVL	TGEYISKDGA	PYCEKDYQGL	FGVKCEACHQ	FITGKVLEAG
DKHYHPSCAR	CSRCNQMFTE	GEEMYLQGST	VWHPDCKQST	KTEEKLRPTR
TSSESIYSRP	GSSIPGSPGH	TIYAKVDNEI	LDYKDLAAIP	KVKAIYDIER
PDLITYEPFY	TSGYDDKQER	QSLGESPRTL	SPTPSAEGYQ	DVRDRMIHRS
TSQGSINSPV	YSRHSYTPTT	SRSPQHFHRP	GNEPSSGRNS	PLPYRPDSRP
LTPTYAQAPK	HFHVPDQGIN	IYRKPPIYKQ	HAALAAQSKS	SEDIIKFSKF
PAAQAPDPSE	TPKIETDHWP	GPPSFAVVGP	DMKRRSSGRE	EDDEELLRRR
QLQEEQLMKL	NSGLGQLILK	EEMEKESRER	SSLLASRYDS	PINSASHIPS
SKTASLPGYG	RNGLHRPVST	DFAQYNSYGD	VSGGVRDYQT	LPDGHMPAMR
MDRGVSMPNM	LEPKIFPYEM	LMVTNRGRNK	ILREVDRTRL	ERHLAPEVFR
EIFGMSIQEF	DRLPLWRRND	MKKKAKLF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Roof D.J., Hayes A., Adamian M., Chishti A.H., Li T. (1997). Molecular characterization of abLIM, a novel actin-binding and double zinc finger protein. J. Cell Biol. 138: 575—588. PMID 9245787 DOI:10.1083/jcb.138.3.575
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ABLIM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:78 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O14639 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.