ABLIM1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ABLIM1, ABLIM, LIMAB1, LIMATIN, abLIM-1, actin binding LIM protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602330 MGI: 1194500 HomoloGene: 40994 GeneCards: ABLIM1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ожиріння, рак простати[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • actin filament binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • lamellipodium • цитоскелет • stress fiber • actin cytoskeleton |
---|
Біологічний процес | • animal organ morphogenesis • cytoskeleton organization • lamellipodium assembly • зір • cilium assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/7e/PBB_GE_ABLIM1_210461_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_ABLIM1_210461_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/70/PBB_GE_ABLIM1_200965_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_ABLIM1_200965_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001003407 NM_001003408 NM_002313 NM_006720 NM_001322882
| NM_001322883 NM_001322884 NM_001322885 NM_001322886 NM_001322887 NM_001322888 NM_001322889 NM_001322890 NM_001322891 NM_001322892 NM_001322893 NM_001322894 NM_001322895 NM_001322896 NM_001322897 NM_001322898 NM_001322899 NM_001322900 NM_001352440 NM_001352441 NM_001352442 NM_001352443 |
| NM_001103177 NM_001103178 NM_001290813 NM_001290815 NM_001290816
| NM_178688 NM_001347459 NM_001362445 NM_001362446 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001003407 NP_001309811 NP_001309812 NP_001309813 NP_001309814
| NP_001309815 NP_001309816 NP_001309817 NP_001309818 NP_001309819 NP_001309820 NP_001309821 NP_001309822 NP_001309823 NP_001309824 NP_001309825 NP_001309826 NP_001309827 NP_001309828 NP_001309829 NP_002304 NP_006711 NP_001339369 NP_001339370 NP_001339371 NP_001339372 |
| NP_001096647 NP_001096648 NP_001277742 NP_001277744 NP_001277745
| NP_001334388 NP_848803 NP_001349374 NP_001349375 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 114.43 – 114.77 Mb | Хр. 19: 57.02 – 57.3 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ABLIM1 (англ. Actin binding LIM protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 778 амінокислот, а молекулярна маса — 87 688[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPAFLGLKCL | | GKLCSSEKSK | | VTSSERTSAR | | GSNRKRLIVE | | DRRVSGTSFT |
AHRRATITHL | | LYLCPKDYCP | | RGRVCNSVDP | | FVAHPQDPHH | | PSEKPVIHCH |
KCGEPCKGEV | | LRVQTKHFHI | | KCFTCKVCGC | | DLAQGGFFIK | | NGEYLCTLDY |
QRMYGTRCHG | | CGEFVEGEVV | | TALGKTYHPN | | CFACTICKRP | | FPPGDRVTFN |
GRDCLCQLCA | | QPMSSSPKET | | TFSSNCAGCG | | RDIKNGQALL | | ALDKQWHLGC |
FKCKSCGKVL | | TGEYISKDGA | | PYCEKDYQGL | | FGVKCEACHQ | | FITGKVLEAG |
DKHYHPSCAR | | CSRCNQMFTE | | GEEMYLQGST | | VWHPDCKQST | | KTEEKLRPTR |
TSSESIYSRP | | GSSIPGSPGH | | TIYAKVDNEI | | LDYKDLAAIP | | KVKAIYDIER |
PDLITYEPFY | | TSGYDDKQER | | QSLGESPRTL | | SPTPSAEGYQ | | DVRDRMIHRS |
TSQGSINSPV | | YSRHSYTPTT | | SRSPQHFHRP | | GNEPSSGRNS | | PLPYRPDSRP |
LTPTYAQAPK | | HFHVPDQGIN | | IYRKPPIYKQ | | HAALAAQSKS | | SEDIIKFSKF |
PAAQAPDPSE | | TPKIETDHWP | | GPPSFAVVGP | | DMKRRSSGRE | | EDDEELLRRR |
QLQEEQLMKL | | NSGLGQLILK | | EEMEKESRER | | SSLLASRYDS | | PINSASHIPS |
SKTASLPGYG | | RNGLHRPVST | | DFAQYNSYGD | | VSGGVRDYQT | | LPDGHMPAMR |
MDRGVSMPNM | | LEPKIFPYEM | | LMVTNRGRNK | | ILREVDRTRL | | ERHLAPEVFR |
EIFGMSIQEF | | DRLPLWRRND | | MKKKAKLF |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Roof D.J., Hayes A., Adamian M., Chishti A.H., Li T. (1997). Molecular characterization of abLIM, a novel actin-binding and double zinc finger protein. J. Cell Biol. 138: 575—588. PMID 9245787 DOI:10.1083/jcb.138.3.575
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ABLIM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:78 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O14639 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |