Гістон H1b |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | H1-5, H1, H1.5, H1B, H1F5, H1s-3, histone cluster 1, H1b, histone cluster 1 H1 family member b, HIST1H1B, H1.5 linker histone, cluster member |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 142711 MGI: 1861461 HomoloGene: 136789 GeneCards: H1-5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • histone deacetylase binding • chromatin DNA binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • double-stranded DNA binding • nucleosomal DNA binding |
---|
Клітинна компонента | • Нуклеосома • екзосома • хромосома • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • establishment of protein localization to chromatin • nucleosome assembly • protein stabilization • positive regulation of cell growth • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of histone H3-K9 methylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chromosome condensation • negative regulation of DNA recombination • muscle organ development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 27.87 – 27.87 Mb | Хр. 13: 21.96 – 21.96 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
Гістон H1b (англ. Histone cluster 1 H1 family member b) – білок, який кодується геном HIST1H1B, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 226 амінокислот, а молекулярна маса — 22 580[4].
Представник родини білків гістонів H1.
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSETAPAETA | | TPAPVEKSPA | | KKKATKKAAG | | AGAAKRKATG | | PPVSELITKA |
VAASKERNGL | | SLAALKKALA | | AGGYDVEKNN | | SRIKLGLKSL | | VSKGTLVQTK |
GTGASGSFKL | | NKKAASGEAK | | PKAKKAGAAK | | AKKPAGATPK | | KAKKAAGAKK |
AVKKTPKKAK | | KPAAAGVKKV | | AKSPKKAKAA | | AKPKKATKSP | | AKPKAVKPKA |
AKPKAAKPKA | | AKPKAAKAKK | | AAAKKK |
Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
- Albig W., Meergans T., Doenecke D. (1997). Characterization of the H1.5 gene completes the set of human H1 subtype genes. Gene. 184: 141—148. PMID 9031620 DOI:10.1016/S0378-1119(96)00582-3
- Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Parseghian M.H., Newcomb R.L., Winokur S.T., Hamkalo B.A. (2000). The distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin: distribution in human fetal fibroblasts. Chromosome Res. 8: 405—424. PMID 10997781 DOI:10.1023/A:1009262819961
- Parseghian M.H., Newcomb R.L., Hamkalo B.A. (2001). Distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin II: distribution in human adult fibroblasts. J. Cell. Biochem. 83: 643—659. PMID 11746507 DOI:10.1002/jcb.1224
- Th'ng J.P., Sung R., Ye M., Hendzel M.J. (2005). H1 family histones in the nucleus. Control of binding and localization by the C-terminal domain. J. Biol. Chem. 280: 27809—27814. PMID 15911621 DOI:10.1074/jbc.M501627200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4719 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 30 січня 2017.
- ↑ UniProt, P16401 (англ.) . Архів оригіналу за 16 листопада 2016. Процитовано 30 січня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |