Аполіпопротеїн M

APOM

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2WEW, 2WEX, 2YG2

Ідентифікатори

Символи

APOM, G3a, HSPC336, NG20, apo-M, apolipoprotein M

Зовнішні ІД

OMIM: 606907 MGI: 1930124 HomoloGene: 10308 GeneCards: APOM

Онтологія гена
Молекулярна функція	• lipid transporter activity • antioxidant activity • phospholipid binding
Клітинна компонента	• discoidal high-density lipoprotein particle • integral component of plasma membrane • very-low-density lipoprotein particle • spherical high-density lipoprotein particle • extracellular region • low-density lipoprotein particle • high-density lipoprotein particle • міжклітинний простір
Біологічний процес	• lipoprotein metabolic process • lipid transport • negative regulation of plasma lipoprotein oxidation • response to glucose • high-density lipoprotein particle assembly • retinoid metabolic process • high-density lipoprotein particle remodeling • cholesterol efflux • cholesterol homeostasis • reverse cholesterol transport • high-density lipoprotein particle clearance • cellular oxidant detoxification
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55937


55938

Ensembl

ENSG00000231974 ENSG00000204444 ENSG00000206409 ENSG00000227567 ENSG00000235754
ENSG00000224290 ENSG00000226215


ENSMUSG00000024391

UniProt


O95445


Q9Z1R3

RefSeq (мРНК)


NM_001256169 NM_019101


NM_018816

RefSeq (білок)


NP_001243098 NP_061974


NP_061286

Локус (UCSC)

Хр. 6: 31.65 – 31.66 Mb

Хр. 17: 35.35 – 35.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Аполіпопротеїн M, APOM (англ. Apolipoprotein M) – білок, який кодується геном APOM, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 188 амінокислот, а молекулярна маса — 21 253^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFHQIWAALL	YFYGIILNSI	YQCPEHSQLT	TLGVDGKEFP	EVHLGQWYFI
AGAAPTKEEL	ATFDPVDNIV	FNMAAGSAPM	QLHLRATIRM	KDGLCVPRKW
IYHLTEGSTD	LRTEGRPDMK	TELFSSSCPG	GIMLNETGQG	YQRFLLYNRS
PHPPEKCVEE	FKSLTSCLDS	KAFLLTPRNQ	EACELSNN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт ліпідів, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

Xu N., Dahlbaeck B. (1999). A novel human apolipoprotein (apoM). J. Biol. Chem. 274: 31286—31290. PMID 10531326 DOI:10.1074/jbc.274.44.31286
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ahnstrom J., Faber K., Axler O., Dahlback B. (2007). Hydrophobic ligand binding properties of the human lipocalin apolipoprotein M. J. Lipid Res. 48: 1754—1762. PMID 17525477 DOI:10.1194/jlr.M700103-JLR200
Axler O., Ahnstrom J., Dahlback B. (2008). Apolipoprotein M associates to lipoproteins through its retained signal peptide. FEBS Lett. 582: 826—828. PMID 18279674 DOI:10.1016/j.febslet.2008.02.007
Duan J., Dahlbaeck B., Villoutreix B.O. (2001). Proposed lipocalin fold for apolipoprotein M based on bioinformatics and site-directed mutagenesis. FEBS Lett. 499: 127—132. PMID 11418126 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02544-3

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13916 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, O95445 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.