Imunoglobulinski domen

IImunoglobulinski domen
Struktura fragmenta koji se vezuje za antigen antitela
Identifikatori
Simbol ig
Pfam PF00047
Pfam klan CL0011
InterPro IPR013151
PROSITE PDOC00262
SCOP 8fab
Superfamilija 8fab
Dostupne PDB strukture:
Pfam structures
PDB RCSB PDB; PDBe
PDBsum strukturni pregled

Imunoglobulinski domen je tip proteinskog domena koji se sastoji od dvoslojnog sendviča sa 7 i 9 antiparalelnih β-lanaca koji formiraju β-ravni sa topologijom Grčkog kluča.[1][2]

Aminokiselinski lanac više puta prelazi iz jedne β-ravni u drugu. Tipičan obrazac je (N-terminalna β-ukosnica u ravni 1)-(β-ukosnica u ravni 2)-(β-lanac u ravni 1)-(C-terminalna β-ukosnica u ravni 2). Prelazi između dve ravni formiraju "X", tako da su N- i C-terminalne ukosnica jedna naspram druge.

Članovi imunoglobulinske superfamilije su prisutni u stotinama proteina sa različitim funkcijama. Primeri tih proteina su antitela, gigantska mišićna kinaza titin i receptorske tirozinske kinaze. Imunoglobulinu slični domeni mogu da učestvujuju u protein–protein i protein–ligand interakcijama.[3]

Primeri

Ljudski geni koji kodiraju proteine sa imunoglobulinskim domenom:

  • A1BG
  • ACAM
  • ADAMTSL1
  • ADAMTSL3
  • AGER
  • ALCAM
  • AMIGO1
  • AMIGO2
  • AXL
  • BCAM
  • BOC
  • BSG
  • BTLA
  • C10orf72
  • C20orf102
  • CADM1
  • CADM3
  • CD200
  • CD22
  • CD276
  • CD33
  • CD4
  • CDON
  • CEACAM1
  • CEACAM16
  • CEACAM20
  • CEACAM21
  • CEACAM5
  • CEACAM6
  • CEACAM8
  • CHL1
  • CILP
  • CNTFR
  • CNTN1
  • CNTN2
  • CNTN3
  • CNTN4
  • CNTN5
  • CNTN6
  • CSF1R
  • DSCAM
  • DSCAML1
  • EMB
  • F11R
  • FAIM3
  • FCAR
  • FCER1A
  • FCGR1A
  • FCGR2A
  • FCGR2B
  • FCGR2C
  • FCGR3A
  • FCGR3B
  • FCRH1
  • FCRH3
  • FCRH4
  • FCRL1
  • FCRL2
  • FCRL3
  • FCRL4
  • FCRL5
  • FCRL6
  • FCRLA
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FGFRL1
  • FLT1
  • FLT3
  • FLT4
  • FSTL4
  • FSTL5
  • GP6
  • GPA33
  • GPR116
  • GPR125
  • HEPACAM
  • HLA-DMA
  • HLA-DMB
  • HLA-DQB
  • HLA-DQB1
  • HMCN1
  • HNT
  • HSPG2
  • HYST2477
  • ICAM3
  • ICAM5
  • IGHA1
  • IGHD
  • IGHE
  • IGSF10
  • IGSF11
  • IGSF2
  • IGSF21
  • IGSF3
  • IGSF9
  • IL11RA
  • IL1R1
  • IL1R2
  • IL1RAPL1
  • IL1RAPL2
  • IL1RL1
  • IL1RL2
  • IL6R
  • JAM2
  • JAM3
  • KIR-123FM
  • KIR2DL1
  • KIR2DL2
  • KIR2DL3
  • KIR2DL4
  • KIR2DL5A
  • KIR2DL5B
  • KIR2DLX
  • KIR2DS1
  • KIR2DS2
  • KIR2DS3
  • KIR2DS4
  • KIR2DS5
  • KIR3DL1
  • KIR3DL2
  • KIR3DL3
  • KIR3DS1
  • KIT
  • L1CAM
  • LAG3
  • LILRA1
  • LILRA2
  • LILRA3
  • LILRA4
  • LILRA5
  • LILRA6
  • LILRB1
  • LILRB2
  • LILRB3
  • LILRB4
  • LILRB5
  • LILRP2
  • LRIG1
  • LRIG2
  • LRIG3
  • LRIT1
  • LRRC4
  • LSAMP
  • MAG
  • MALT1
  • MCAM
  • MDGA1
  • MDGA2
  • MERTK
  • MFAP3
  • MIR
  • MIR
  • MXRA5
  • MYBPC3
  • MYOM1
  • MYOM3
  • NCA
  • NCAM1
  • NCAM2
  • NEGR1
  • NEO1
  • NFASC
  • NOPE
  • NPHS1
  • NPTN
  • NRCAM
  • NRG1
  • NT
  • NTRK3
  • OBSCN
  • OBSL1
  • OPCML
  • PAPLN
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDGFRL
  • PECAM1
  • PRODH2
  • PSG1
  • PSG10
  • PSG11
  • PSG11s'
  • PSG2
  • PSG3
  • PSG4
  • PSG5
  • PSG6
  • PSG7
  • PSG8
  • PSG9
  • PTGFRN
  • PTK7
  • PTPRD
  • PTPRK
  • PTPRM
  • PTPRS
  • PTPsigma
  • PUNC
  • PVR
  • PVRL1
  • PVRL2
  • PVRL4
  • RAGE
  • SCN1B
  • SDK1
  • SDK2
  • SEMA3A
  • SEMA3B
  • SEMA3E
  • SEMA3F
  • SEMA3G
  • SEMA4D
  • SIGLEC1
  • SIGLEC10
  • SIGLEC11
  • SIGLEC12
  • SIGLEC14
  • SIGLEC6
  • SIGLEC7
  • SIGLEC8
  • SIRPG
  • THY1
  • TIE1
  • TMIGD1
  • TMIGD2
  • TTN
  • TYRO3
  • UNC5D
  • VCAM1
  • VSIG1
  • VSIG2
  • VSIG4
  • hEMMPRIN
  • kir3d

Reference

  1. Bork P, Holm L, Sander C (September 1994). „The immunoglobulin fold. Structural classification, sequence patterns and common core”. J. Mol. Biol. 242 (4): 309–20. DOI:10.1006/jmbi.1994.1582. PMID 7932691. 
  2. Brümmendorf T, Rathjen FG (1995). „Cell adhesion molecules 1: immunoglobulin superfamily”. Protein Profile 2 (9): 963–1108. PMID 8574878. 
  3. Williams AF, Barclay AN (1988). „The immunoglobulin superfamily—domains for cell surface recognition”. Annu. Rev. Immunol. 6: 381–405. DOI:10.1146/annurev.iy.06.040188.002121. PMID 3289571. 

See also

Spoljašnje veze

  • SCOP listing of immunoglobulin domains of known structure Arhivirano 2010-01-16 na Wayback Machine-u