Куллин 7

Куллин 7
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2JNG

Идентификаторы
ПсевдонимыCUL7, 3M1, KIAA0076, dJ20C7.5, cullin 7, CUL-7
Внешние IDOMIM: 609577 MGI: 1913765 HomoloGene: 56683 GeneCards: CUL7
Расположение гена (человек)
6-я хромосома человека
Хр.6-я хромосома человека[1]
6-я хромосома человека
Расположение в геноме CUL7
Расположение в геноме CUL7
Локус6p21.1Начало43,037,617 bp[1]
Конец43,053,943 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
17-я хромосома мыши
Хр.17-я хромосома мыши[2]
17-я хромосома мыши
Расположение в геноме CUL7
Расположение в геноме CUL7
Локус17|17 CНачало46,961,263 bp[2]
Конец46,975,290 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • stromal cell of endometrium

  • right uterine tube

  • right adrenal cortex

  • right lobe of thyroid gland

  • ventricular zone

  • right hemisphere of cerebellum
Наибольшая экспрессия в
  • saccule

  • otic vesicle

  • otic placode

  • efferent ductule
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • связывание с белками плазмы
  • ubiquitin protein ligase binding
Компонент клетки
  • цитоплазма
  • цитозоль
  • центросома
  • аппарат Гольджи
  • центр организации микротрубочек
  • Cul7-RING ubiquitin ligase complex
  • perinuclear region of cytoplasm
  • Комплекс стимуляции анафазы
  • 3M complex
  • цитоскелет
Биологический процесс
  • Golgi organization
  • ubiquitin-dependent protein catabolic process
  • Плацентация
  • mitotic cytokinesis
  • протеолиз
  • васкулогенез
  • IRE1-mediated unfolded protein response
  • positive regulation of dendrite morphogenesis
  • protein ubiquitination
  • Эпителиально-мезенхимальный переход
  • вирусный процесс
  • microtubule cytoskeleton organization
  • regulation of mitotic nuclear division
  • посттрансляционная модификация
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

9820

66515

Ensembl

ENSG00000044090

ENSMUSG00000038545

UniProt

Q14999

Q8VE73

RefSeq (мРНК)

NM_001168370
NM_014780
NM_001374872
NM_001374873
NM_001374874

NM_025611

RefSeq (белок)

NP_001161842
NP_055595
NP_001361801
NP_001361802
NP_001361803

NP_079887

Локус (UCSC)Chr 6: 43.04 – 43.05 MbChr 17: 46.96 – 46.98 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Куллин-7 (англ. Cullin-7,CUL7 ) — белок, кодируемый у человека геном CUL7[5][6][7].

Белок, кодируемый этим геном, является компонентом белкового комплекса убиквитинлигазы E3. Кодируемый белок взаимодействует с белками P53, CUL9 и FBXW8[англ.]. Дефекты этого гена являются причиной синдрома 3М[англ.] типа 1 (3M1). Были найдены два варианта транскрипта, кодирующие различные изоформы[7].

Взаимодействия

CUL7, как было выявлено, взаимодействует с RBX1[англ.] [8].

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000044090 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038545 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Dias D.C., Dolios G., Wang R., Pan Z.Q. CUL7: A DOC domain-containing cullin selectively binds Skp1.Fbx29 to form an SCF-like complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — December (vol. 99, no. 26). — P. 16601—16606. — doi:10.1073/pnas.252646399. — PMID 12481031. — PMC 139190.
  6. ↑ Arai T., Kasper J.S., Skaar J.R., Ali S.H., Takahashi C., DeCaprio J.A. Targeted disruption of p185/Cul7 gene results in abnormal vascular morphogenesis (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — August (vol. 100, no. 17). — P. 9855—9860. — doi:10.1073/pnas.1733908100. — PMID 12904573. — PMC 187864.
  7. ↑ 1 2 Entrez Gene: CUL7 cullin 7  (неопр.). Архивировано 7 марта 2010 года.
  8. ↑ Dias, Dora C; Dolios Georgia, Wang Rong, Pan Zhen-Qiang. CUL7: A DOC domain-containing cullin selectively binds Skp1.Fbx29 to form an SCF-like complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — United States, 2002. — December (vol. 99, no. 26). — P. 16601—16606. — ISSN 0027-8424. — doi:10.1073/pnas.252646399. — PMID 12481031. — PMC 139190.

Литература

  • Kim S.S., Shago M., Kaustov L. et al. CUL7 is a novel antiapoptotic oncogene. (англ.) // Cancer Res.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 67, no. 20. — P. 9616—9622. — doi:10.1158/0008-5472.CAN-07-0644. — PMID 17942889.
  • Jung P., Verdoodt B., Bailey A. et al. Induction of cullin 7 by DNA damage attenuates p53 function. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2007. — Vol. 104, no. 27. — P. 11388—11393. — doi:10.1073/pnas.0609467104. — PMID 17586686. — PMC 2040908.
  • Skaar J.R., Florens L., Tsutsumi T. et al. PARC and CUL7 form atypical cullin RING ligase complexes. (англ.) // Cancer Res.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 67, no. 5. — P. 2006—2014. — doi:10.1158/0008-5472.CAN-06-3241. — PMID 17332328.
  • Kaustov L., Lukin J., Lemak A. et al. The conserved CPH domains of Cul7 and PARC are protein-protein interaction modules that bind the tetramerization domain of p53. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2007. — Vol. 282, no. 15. — P. 11300—11307. — doi:10.1074/jbc.M611297200. — PMID 17298945.
  • Kasper J.S., Arai T., DeCaprio J.A. A novel p53-binding domain in CUL7. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 348, no. 1. — P. 132—138. — doi:10.1016/j.bbrc.2006.07.013. — PMID 16875676.
  • Andrews P., He Y.J., Xiong Y. Cytoplasmic localized ubiquitin ligase cullin 7 binds to p53 and promotes cell growth by antagonizing p53 function. (англ.) // Oncogene : journal. — 2006. — Vol. 25, no. 33. — P. 4534—4548. — doi:10.1038/sj.onc.1209490. — PMID 16547496.
  • Huber C., Dias-Santagata D., Glaser A. et al. Identification of mutations in CUL7 in 3-M syndrome. (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2005. — Vol. 37, no. 10. — P. 1119—1124. — doi:10.1038/ng1628. — PMID 16142236.
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A. et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Mungall A.J., Palmer S.A., Sims S.K. et al. The DNA sequence and analysis of human chromosome 6. (англ.) // Nature : journal. — 2003. — Vol. 425, no. 6960. — P. 805—811. — doi:10.1038/nature02055. — PMID 14574404.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Nakayama M., Kikuno R., Ohara O. Protein-protein interactions between large proteins: two-hybrid screening using a functionally classified library composed of long cDNAs. (англ.) // Genome Res. : journal. — 2003. — Vol. 12, no. 11. — P. 1773—1784. — doi:10.1101/gr.406902. — PMID 12421765. — PMC 187542.
  • Winston J.T., Koepp D.M., Zhu C. et al. A family of mammalian F-box proteins. (англ.) // Curr. Biol. : journal. — 1999. — Vol. 9, no. 20. — P. 1180—1182. — doi:10.1016/S0960-9822(00)80021-4. — PMID 10531037.
  • Nomura N., Nagase T., Miyajima N. et al. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. II. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0041-KIAA0080) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. (англ.) // DNA Res.[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 1, no. 5. — P. 223—229. — doi:10.1093/dnares/1.5.223. — PMID 7584044.

Ссылки

  • GeneReviews/NIH/NCBI/UW entry on 3-M syndrome
  • OMIM entries entry on 3-M syndrome