| TCF4 |
|---|
|
| Estruturas disponíveis |
|---|
| PDB | Pesquisa Human UniProt: PDBe RCSB |
|---|
| Lista de códigos id do PDB |
|---|
2KWF |
|
|
| Identificadores |
|---|
| Nomes alternativos | TCF4 |
|---|
| IDs externos | OMIM: 602272 HomoloGene: 2407 GeneCards: TCF4 |
|---|
|
| Doenças Geneticamente Relacionadas |
|---|
| morbid obesity, esquizofrenia, colite ulcerosa, sclerosing cholangitis, Distrofia de Fuchs, Pitt-Hopkins syndrome, Distrofia de Fuchs[1] |
| Ontologia genética |
|---|
| Função molecular | • protein dimerization activity
• protein homodimerization activity
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
• GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
• bHLH transcription factor binding
• E-box binding
• protein C-terminus binding
• GO:0001948, GO:0016582 ligação a proteínas plasmáticas
• identical protein binding
• TFIIB-class transcription factor binding
• protein heterodimerization activity
• DNA binding
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
• GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Componente celular | • transcription regulator complex
• núcleo celular
• beta-catenin-TCF complex
• beta-catenin-TCF7L2 complex
|
|---|
| Processo biológico | • diferenciação celular
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• protein-DNA complex assembly
• transcription, DNA-templated
• nervous system development
• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
• DNA-templated transcription, initiation
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• positive regulation of neuron differentiation
|
|---|
| Sources:Amigo / QuickGO |
|
| Ortólogos |
|---|
| Espécie | Humano | Rato |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | NM_001083962
NM_001243226
NM_001243227
NM_001243228
NM_001243230
|
|---|
NM_001243231
NM_001243232
NM_001243233
NM_001243234
NM_001243235
NM_001243236
NM_001306207
NM_001306208
NM_003199
NM_001330604
NM_001330605
NM_001348211
NM_001348212
NM_001348213
NM_001348214
NM_001348215
NM_001348216
NM_001348217
NM_001348218
NM_001348219
NM_001348220
NM_001369572
NM_001369573
NM_001369574
NM_001369575
NM_001369576
NM_001369577
NM_001369578
NM_001369579
NM_001369580
NM_001369581
NM_001369582
NM_001369583
NM_001369584
NM_001369585
NM_001369586
NM_001369567
NM_001369568
NM_001369569
NM_001369570
NM_001369571 |
| |
|---|
| RefSeq (proteína) | NP_001077431
NP_001230155
NP_001230156
NP_001230157
NP_001230159
|
|---|
NP_001230160
NP_001230161
NP_001230162
NP_001230163
NP_001230164
NP_001230165
NP_001293136
NP_001293137
NP_001317533
NP_001317534
NP_003190
NP_001335140
NP_001335141
NP_001335142
NP_001335143
NP_001335144
NP_001335145
NP_001335146
NP_001335147
NP_001335148
NP_001335149
NP_001356501
NP_001356502
NP_001356503
NP_001356504
NP_001356505
NP_001356506
NP_001356507
NP_001356508
NP_001356509
NP_001356510
NP_001356511
NP_001356512
NP_001356513
NP_001356514
NP_001356515
NP_001356496
NP_001356497
NP_001356498
NP_001356499
NP_001356500 |
| |
|---|
| Localização (UCSC) | n/a | n/a |
|---|
| Pesquisa PubMed | [2] | n/a |
|---|
|
| Wikidata |
|
Fator de transcrição 4 (TCF-4) também conhecido como fator de transcrição de imunoglobulina 2 (ITF-2) é uma proteína que em humanos é codificada pelo gene TCF4 localizado no cromossomo 18q21.2.[3]
Funções
As proteínas TCF4 atuam como fatores de transcrição que se ligam ao motivo mu-E5 / kappa-E2, que aumenta a imunoglobulina. TCF4 ativa a transcrição ligando-se à sequência E-box (5’-CANNTG-3 ’) encontrada geralmente no elemento iniciador do SSTR2-INR ou receptor 2 da somatostatina. Posteriormente, ele será encontrado na tireóide, no timo e nos rins, enquanto na idade adulta o TCF4 é encontrado nos linfócitos, músculos e sistema gastrointestinal.[4][5]
Importância clínica
Mutações no TCF4 causam a síndrome de Pitt-Hopkins (PTHS). Essas mutações fazem com que as proteínas TCF4 não se liguem ao DNA adequadamente e controlem a diferenciação do sistema nervoso. Na maioria dos casos estudados, as mutações foram de novo, o que significa que foi uma nova mutação não encontrada em outros membros da família do paciente. Os sintomas comuns da síndrome de Pitt-Hopkins incluem boca larga, problemas gastrointestinais, atraso no desenvolvimento de habilidades motoras finas, problemas de fala e respiração, epilepsia e outros defeitos cerebrais.[6][7]
Um estudo identificou o gene TCF4 como um regulador principal da esquizofrenia.[8]
Referências
- ↑ «Doenças geneticamente associadas a TCF4 ver/editar referências no wikidata»
- ↑ «Human PubMed Reference:»
- ↑ Henthorn P, McCarrick-Walmsley R, Kadesch T (fevereiro de 1990). «Sequence of the cDNA encoding ITF-2, a positive-acting transcription factor». Nucleic Acids Research. 18 (3). 678 páginas. PMC 333500
. PMID 2308860. doi:10.1093/nar/18.3.678 - ↑ de Pontual L, Mathieu Y, Golzio C, Rio M, Malan V, Boddaert N, et al. (abril de 2009). «Mutational, functional, and expression studies of the TCF4 gene in Pitt-Hopkins syndrome». Human Mutation. 30 (4): 669–76. PMID 19235238. doi:10.1002/humu.20935
- ↑ Pscherer A, Dörflinger U, Kirfel J, Gawlas K, Rüschoff J, Buettner R, Schüle R (dezembro de 1996). «The helix-loop-helix transcription factor SEF-2 regulates the activity of a novel initiator element in the promoter of the human somatostatin receptor II gene». The EMBO Journal. 15 (23): 6680–90. PMC 452492. PMID 8978694
- ↑ Amiel J, Rio M, de Pontual L, Redon R, Malan V, Boddaert N, et al. (maio de 2007). «Mutations in TCF4, encoding a class I basic helix-loop-helix transcription factor, are responsible for Pitt-Hopkins syndrome, a severe epileptic encephalopathy associated with autonomic dysfunction». American Journal of Human Genetics. 80 (5): 988–93. PMC 1852736. PMID 17436254. doi:10.1086/515582
- ↑ Zweier C, Peippo MM, Hoyer J, Sousa S, Bottani A, Clayton-Smith J, et al. (maio de 2007). «Haploinsufficiency of TCF4 causes syndromal mental retardation with intermittent hyperventilation (Pitt-Hopkins syndrome)». American Journal of Human Genetics. 80 (5): 994–1001. PMC 1852727. PMID 17436255. doi:10.1086/515583
- ↑ «Scientists recognize genes as master regulators in schizophrenia». Tech Explorist (em inglês). 16 de setembro de 2019. Consultado em 16 de setembro de 2019
Leitura adicional
- Herbst A, Helferich S, Behrens A, Göke B, Kolligs FT (outubro de 2009). «The transcription factor ITF-2A induces cell cycle arrest via p21(Cip1)». Biochemical and Biophysical Research Communications. 387 (4): 736–40. PMID 19635457. doi:10.1016/j.bbrc.2009.07.102
- Cisse B, Caton ML, Lehner M, Maeda T, Scheu S, Locksley R, Holmberg D, Zweier C, den Hollander NS, Kant SG, Holter W, Rauch A, Zhuang Y, Reizis B (outubro de 2008). «Transcription factor E2-2 is an essential and specific regulator of plasmacytoid dendritic cell development». Cell. 135 (1): 37–48. PMC 2631034. PMID 18854153. doi:10.1016/j.cell.2008.09.016
- Bain G, Murre C (abril de 1998). «The role of E-proteins in B- and T-lymphocyte development». Seminars in Immunology. 10 (2): 143–53. PMID 9618760. doi:10.1006/smim.1998.0116
- Yerges LM, Klei L, Cauley JA, Roeder K, Kammerer CM, Moffett SP, et al. (dezembro de 2009). «High-density association study of 383 candidate genes for volumetric BMD at the femoral neck and lumbar spine among older men». Journal of Bone and Mineral Research. 24 (12): 2039–49. PMC 2791518. PMID 19453261. doi:10.1359/jbmr.090524
- Purcell SM, Wray NR, Stone JL, Visscher PM, O'Donovan MC, Sullivan PF, Sklar P (agosto de 2009). «Common polygenic variation contributes to risk of schizophrenia and bipolar disorder». Nature. 460 (7256): 748–52. PMC 3912837. PMID 19571811. doi:10.1038/nature08185
- Kalscheuer VM, Feenstra I, Van Ravenswaaij-Arts CM, Smeets DF, Menzel C, Ullmann R, Musante L, Ropers HH (agosto de 2008). «Disruption of the TCF4 gene in a girl with mental retardation but without the classical Pitt-Hopkins syndrome». American Journal of Medical Genetics Part A. 146A (16): 2053–9. PMID 18627065. doi:10.1002/ajmg.a.32419
- Herbst A, Bommer GT, Kriegl L, Jung A, Behrens A, Csanadi E, et al. (agosto de 2009). «ITF-2 is disrupted via allelic loss of chromosome 18q21, and ITF-2B expression is lost at the adenoma-carcinoma transition». Gastroenterology. 137 (2): 639–48, 648.e1-9. PMID 19394332. doi:10.1053/j.gastro.2009.04.049
- Nagasawa M, Schmidlin H, Hazekamp MG, Schotte R, Blom B (setembro de 2008). «Development of human plasmacytoid dendritic cells depends on the combined action of the basic helix-loop-helix factor E2-2 and the Ets factor Spi-B». European Journal of Immunology. 38 (9): 2389–400. PMID 18792017. doi:10.1002/eji.200838470
- Rosenfeld JA, Leppig K, Ballif BC, Thiese H, Erdie-Lalena C, Bawle E, Sastry S, Spence JE, Bandholz A, Surti U, Zonana J, Keller K, Meschino W, Bejjani BA, Torchia BS, Shaffer LG (novembro de 2009). «Genotype-phenotype analysis of TCF4 mutations causing Pitt-Hopkins syndrome shows increased seizure activity with missense mutations». Genetics in Medicine. 11 (11): 797–805. PMID 19938247. doi:10.1097/GIM.0b013e3181bd38a9
- Stefansson H, Ophoff RA, Steinberg S, Andreassen OA, Cichon S, Rujescu D, et al. (agosto de 2009). «Common variants conferring risk of schizophrenia». Nature. 460 (7256): 744–7. PMC 3077530. PMID 19571808. doi:10.1038/nature08186
 | Este artigo sobre Genética é um esboço. Você pode ajudar a Wikipédia expandindo-o. |
Portal da genética
Portal da bioquímica
