| H2BC5 |
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| Estruturas disponíveis |
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| PDB | Pesquisa Human UniProt: PDBe RCSB |
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| Lista de códigos id do PDB |
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5KGF |
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| Identificadores |
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| Nomes alternativos | H2BC5 |
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| IDs externos | OMIM: 602799 HomoloGene: 134740 GeneCards: H2BC5 |
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| Ontologia genética |
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| Função molecular | • protein heterodimerization activity
• DNA binding
• função molecular
• GO:0001948, GO:0016582 ligação a proteínas plasmáticas
• identical protein binding
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| Componente celular | • cromossoma
• nucleossoma
• Exossoma
• cariolinfa
• núcleo celular
• citosol
• extracellular space
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| Processo biológico | • nucleosome assembly
• protein ubiquitination
• innate immune response in mucosa
• defense response to bacterium
• antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide
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| Sources:Amigo / QuickGO |
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| Ortólogos |
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| Espécie | Humano | Rato |
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| Entrez | | |
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| Ensembl | | |
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| UniProt | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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| RefSeq (proteína) | |
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NP_066407
NP_619790
NP_003517
NP_001368918 |
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| Localização (UCSC) | n/a | n/a |
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| Pesquisa PubMed | [1] | n/a |
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| Wikidata |
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A Histona H2B tipo 1-D é uma proteína que em humanos é codificada pelo gene HIST1H2BD.[2][3][4]
As histonas são proteínas nucleares básicas que são responsáveis pela estrutura dos nucleossomos da fibra cromossômica nos eucariotos. Duas moléculas de cada uma das quatro histonas do núcleo (H2A, H2B, H3 e H4) formam um octâmero, em torno do qual aproximadamente 146 pb de DNA é envolvido em unidades repetidas, chamadas nucleossomos. A histona ligante, H1, interage com o DNA ligante entre nucleossomos e funciona na compactação da cromatina em estruturas de ordem superior. Este gene é desprovido de intrones e codifica um membro da família histona H2B. Os transcritos desse gene não possuem caudas de poli A, mas contêm um elemento de terminação palindrômico. Este gene é encontrado no pequeno agrupamento de genes de histonas no cromossomo 6p22-p21.3.[4]
Leitura adicional
- Albig W, Kioschis P, Poustka A, et al. (1997). «Human histone gene organization: nonregular arrangement within a large cluster». Genomics. 40 (2): 314–22. PMID 9119399. doi:10.1006/geno.1996.4592
- Albig W, Doenecke D (1998). «The human histone gene cluster at the D6S105 locus». Hum. Genet. 101 (3): 284–94. PMID 9439656. doi:10.1007/s004390050630
- El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). «Transcriptional Activation of the Integrated Chromatin-Associated Human Immunodeficiency Virus Type 1 Promoter». Mol. Cell. Biol. 18 (5): 2535–44. PMC 110633
. PMID 9566873. doi:10.1128/mcb.18.5.2535 - Lorain S, Quivy JP, Monier-Gavelle F, et al. (1998). «Core Histones and HIRIP3, a Novel Histone-Binding Protein, Directly Interact with WD Repeat Protein HIRA». Mol. Cell. Biol. 18 (9): 5546–56. PMC 109139. PMID 9710638. doi:10.1128/MCB.18.9.5546
- Deng L, de la Fuente C, Fu P, et al. (2001). «Acetylation of HIV-1 Tat by CBP/P300 increases transcription of integrated HIV-1 genome and enhances binding to core histones». Virology. 277 (2): 278–95. PMID 11080476. doi:10.1006/viro.2000.0593
- Deng L, Wang D, de la Fuente C, et al. (2001). «Enhancement of the p300 HAT activity by HIV-1 Tat on chromatin DNA». Virology. 289 (2): 312–26. PMID 11689053. doi:10.1006/viro.2001.1129
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. PMC 139241. PMID 12477932. doi:10.1073/pnas.242603899
- Cheung WL, Ajiro K, Samejima K, et al. (2003). «Apoptotic phosphorylation of histone H2B is mediated by mammalian sterile twenty kinase». Cell. 113 (4): 507–17. PMID 12757711. doi:10.1016/S0092-8674(03)00355-6
- Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, et al. (2003). «The DNA sequence and analysis of human chromosome 6». Nature. 425 (6960): 805–11. PMID 14574404. doi:10.1038/nature02055
- Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). «Regulation of HIV-1 gene expression by histone acetylation and factor recruitment at the LTR promoter». EMBO J. 22 (24): 6550–61. PMC 291826. PMID 14657027. doi:10.1093/emboj/cdg631
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. PMC 528928. PMID 15489334. doi:10.1101/gr.2596504
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). «Nucleolar proteome dynamics». Nature. 433 (7021): 77–83. PMID 15635413. doi:10.1038/nature03207
- Golebiowski F, Kasprzak KS (2007). «Inhibition of core histones acetylation by carcinogenic nickel(II)». Mol. Cell. Biochem. 279 (1–2): 133–9. PMID 16283522. doi:10.1007/s11010-005-8285-1
- Zhu B, Zheng Y, Pham AD, et al. (2006). «Monoubiquitination of human histone H2B: the factors involved and their roles in HOX gene regulation». Mol. Cell. 20 (4): 601–11. PMID 16307923. doi:10.1016/j.molcel.2005.09.025
- Bonenfant D, Coulot M, Towbin H, et al. (2006). «Characterization of histone H2A and H2B variants and their post-translational modifications by mass spectrometry». Mol. Cell. Proteomics. 5 (3): 541–52. PMID 16319397. doi:10.1074/mcp.M500288-MCP200
- Siuti N, Roth MJ, Mizzen CA, et al. (2006). «Gene-specific characterization of human histone H2B by electron capture dissociation». J. Proteome Res. 5 (2): 233–9. PMID 16457587. doi:10.1021/pr050268v
- Beck HC, Nielsen EC, Matthiesen R, et al. (2006). «Quantitative proteomic analysis of post-translational modifications of human histones». Mol. Cell. Proteomics. 5 (7): 1314–25. PMID 16627869. doi:10.1074/mcp.M600007-MCP200
- Pavri R, Zhu B, Li G, et al. (2006). «Histone H2B monoubiquitination functions cooperatively with FACT to regulate elongation by RNA polymerase II». Cell. 125 (4): 703–17. PMID 16713563. doi:10.1016/j.cell.2006.04.029
Referências
- ↑ «Human PubMed Reference:»
- ↑ Albig W, Kardalinou E, Drabent B, Zimmer A, Doenecke D (novembro de 1991). «Isolation and characterization of two human H1 histone genes within clusters of core histone genes». Genomics. 10 (4): 940–8. PMID 1916825. doi:10.1016/0888-7543(91)90183-F
- ↑ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (outubro de 2002). «The human and mouse replication-dependent histone genes». Genomics. 80 (5): 487–98. PMID 12408966. doi:10.1016/S0888-7543(02)96850-3
- ↑ a b «Entrez Gene: HIST1H2BD histone cluster 1, H2bd»
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