TFIID
TFIID(transcription factor II D)は、RNAポリメラーゼIIの転写開始前複合体を構成する基本転写因子の1つである。RNAポリメラーゼIIホロ酵素(英語版)は、真核生物のRNAポリメラーゼIIが生細胞内のタンパク質コーディング遺伝子のプロモーターへリクルートされる形態であり、RNAポリメラーゼ、一部の基本転写因子、SRBタンパク質と呼ばれる調節タンパク質から構成される。転写の開始前には、TFIID複合体は遺伝子のコアプロモーターのTATAボックスに結合する
構造
TFIIDはTATA結合タンパク質(TBP)と、TBP関連因子(英語版)(TBP-associated factors、TAF)と呼ばれるいくつかのサブユニットから構成される。試験管内では、TATAボックスを含むプロモーターの転写にはTBPのみが必要である[1]。しかしながら、TAFはプロモーター選択性を付与し、TBPが結合するTATAボックスが存在しない場合に特に重要である[2]。TAFはTFIID[3]そしてB-TFIID[4]と呼ばれる2種類の異なる複合体中に存在する。TFIID複合体はTBPと8種類以上のTAFから構成される。しかし、TBPの大部分はB-TFIID複合体中に存在し、この複合体はTBPとTAFII170(BTAF1(英語版))が1:1の比率で結合したものである[5]。TFIIDとB-TFIIDは機能的に等価ではなく、TFIIDを用いた転写反応はSP1などの遺伝子特異的転写因子に応答するのに対し、B-TFIIDを用いて再構成された転写反応では応答しない[5]。
TFIID複合体のサブユニットには次のようなものがある[1]。
- TBP (TATA結合タンパク質)
- または動物に存在するTBP関連因子 (TBPL1(英語版); TBPL2(英語版))[6]
- TAF1(英語版) (TAFII250)
- TAF2(英語版) (CIF150)
- TAF3(英語版) (TAFII140)
- TAF4(英語版) (TAFII130/135)
- TAF4B(英語版) (TAFII105)
- TAF5(英語版) (TAFII100)
- TAF6(英語版) (TAFII70/80)
- TAF7(英語版) (TAFII55)
- TAF8(英語版) (TAFII43)
- TAF9(英語版) (TAFII31/32)
- TAF9B(英語版) (TAFII31L)
- TAF10(英語版) (TAFII30)
- TAF11(英語版) (TAFII28)
- TAF12(英語版) (TAFII20/15)
- TAF13(英語版) (TAFII18)
- TAF15(英語版) (TAFII68)
出典
- ^ a b Lee, Tong Ihn; Young, Richard A. (2000). “Transcription of eukaryotic protein-coding genes”. Annu. Rev. Genet. 34: 77–137. doi:10.1146/annurev.genet.34.1.77. PMID 11092823.
- ^ Louder, RK; He, Y; López-Blanco, JR; Fang, J; Chacón, P; Nogales, E (2016). “Structure of promoter-bound TFIID and model of human pre-initiation complex assembly”. Nature 531 (7596): 604–609. Bibcode: 2016Natur.531..604L. doi:10.1038/nature17394. PMC 4856295. PMID 27007846. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4856295/.
- ^ Dynlacht, Brian David; Hoey, Timothy; Tjian, Robert (Aug 1991). “Isolation of co-activators associated with the TATA-binding protein that mediate transcriptional activation”. Cell 66 (3): 563–576. doi:10.1016/0092-8674(81)90019-2. PMID 1907890.
- ^ “NCBI Entrez GeneID: 9044 BTAF1 BTAF1 RNA polymerase II, B-TFIID transcription factor-associated, 170 kDa (Mot1 homolog, S. cerevisiae)”. 2022年4月3日閲覧。
- ^ a b Timmers, H.; Meyers, RE; Sharp, PA (Sep 1992). “Composition of transcription factor B-TFIID”. Proc Natl Acad Sci USA 89 (17): 8140–4. Bibcode: 1992PNAS...89.8140T. doi:10.1073/pnas.89.17.8140. PMC 49872. PMID 1387711. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC49872/.
- ^ Duttke, SH (March 2015). “Evolution and diversification of the basal transcription machinery.”. Trends in Biochemical Sciences 40 (3): 127–9. doi:10.1016/j.tibs.2015.01.005. PMC 4410091. PMID 25661246. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4410091/.
関連項目
- 真核生物の転写(英語版)
- 基本転写因子
- 転写開始前複合体
- 遺伝子発現の調節
- RNAポリメラーゼIIホロ酵素(英語版)
- TATA結合タンパク質
- 転写 (生物学)
外部リンク
- Transcription Factor TFIID - MeSH・アメリカ国立医学図書館・生命科学用語シソーラス(英語)
- 3D electron microscopy structures of TFIID from the EM Data Bank(EMDB)
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