Kancellár | Hivatali idő | Megjegyzés |
| | 1540–1551 között az erdélyi közigazgatás még kialakulófélben volt; Izabella és Fráter György kormányzása idején a kancelláriát egy titkár vezette. |
Csáky Mihály | 1556–1571 | |
Forgách Ferenc | 1571–1575 | |
| | 1575 vége–1576 eleje között a tisztség betöltetlen volt. |
Sulyok Imre | 1576–1578 | |
Berzeviczy Márton | 1578–1586 | Báthory István mellett Lengyelországban |
Kovacsóczy Farkas | 1578–1594 | Báthory Kristóf és Báthory Zsigmond vajdák kancellárja 1586-ig |
Jósika István | 1594–1598 | |
Naprágyi Demeter | 1598–1600 | |
| | 1600 és 1603 között a tisztség betöltetlen, a kancelláriát feltehetően titkár vezette. |
Jacobinus János | 1603 | |
Káthay Mihály | 1604–1606 | |
| | Káthay letartóztatása után a tisztség betöltetlen maradt, a kancelláriát a titkári rangban levő Péchi Simon vezette. |
Petki János | 1607–1608 | |
Kendi István | 1608–1610 | |
Imreffi János | 1610–1611 | |
| | Imreffi halála után a kancelláriát feltehetően a titkári rangú Hidy György vezette. |
Péchi Simon | 1613–1621 | |
| | Péchi letartóztatása után Kovacsóczy István egy ideig titkári rangban helyettesítette. |
Kovacsóczy István | 1622–1634 | |
| | Kovacsóczy halála után a kancelláriát 1644-ig az ítélőmester Kassai István vezette, utána 1649-ig Szalárdi János titkár, majd Pálóczi Horvát János titkár. |
Mikes Mihály | 1656–1660 | |
Bethlen János | 1659–1678 | |
Bethlen Farkas | 1678–1679 | |
| | 1679–1690 között a kancellár feladatköre több személy között oszlott meg. |
| | 1694-től: Erdélyi Udvari Kancellária, eltérő feladatkörrel |