SATB1

Structures disponibles

PDB

Recherche d'orthologue: PDBe RCSB

Identifiants PDB
1YSE, 2L1P, 2O49, 2O4A, 3NZL, 3TUO, 2MW8

Identifiants

Aliases

SATB1

IDs externes

OMIM: 602075 MGI: 105084 HomoloGene: 2232 GeneCards: SATB1

Position du gène (Homme)

Chr.	Chromosome 3 humain^[1]

Locus	3p24.3	Début	18,345,377 bp^[1]
Locus	3p24.3	Fin	18,445,588 bp^[1]

Position du gène (Souris)

Chr.	Chromosome 17 (souris)^[2]

Locus	17\|17 C	Début	52,043,215 bp^[2]
Locus	17\|17 C	Fin	52,140,318 bp^[2]

Expression génétique

Bgee

Humain

Souris (orthologue)

Fortement exprimé dans

cortex orbitofrontal

frontal pole

thymus

Brodmann area 46

lobe pariétal

gyrus postcentral

parotide

Brodmann area 10

Cortex entorhinal

Brodmann area 23

Fortement exprimé dans

thymus

molaire

barrel cortex

zygote

secondary oocyte

Rostral migratory stream

substantia nigra

glande lacrymale

muscle vaste latéral

sang

Plus de données d'expression de référence

BioGPS


Plus de données d'expression de référence

Gene Ontology
Fonction moléculaire	liaison ADN RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription factor activity liaison de chromatine liaison protéique DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific double-stranded DNA binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific sequence-specific DNA binding
Composant cellulaire	PML body matrice nucléaire nucléoplasme chromatine noyau corps nucléaire
Processus biologique	réflexe CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation Remodelage de la chromatine activated T cell proliferation regulation of transcription, DNA-templated negative regulation of transcription by RNA polymerase II organisation de la chromatine transcription, DNA-templated epidermis development histone methylation viral process T cell activation
Sources:Amigo / QuickGO

Orthologues

Espèces

Homme

Souris

Entrez


6304


20230

Ensembl


ENSG00000182568


ENSMUSG00000023927

UniProt


Q01826


Q60611

RefSeq (mRNA)

NM_001131010 NM_001195470 NM_002971 NM_001322871 NM_001322872
NM_001322873 NM_001322874 NM_001322875 NM_001322876

NM_001163630 NM_001163631 NM_001163632 NM_009122 NM_001357636
NM_001357637 NM_001357638 NM_001357640

RefSeq (protéine)

NP_001124482 NP_001182399 NP_001309800 NP_001309801 NP_001309802
NP_001309803 NP_001309804 NP_001309805 NP_002962

NP_001157102 NP_001157103 NP_001157104 NP_033148 NP_001344565
NP_001344566 NP_001344567 NP_001344569

Localisation (UCSC)

Chr 3: 18.35 – 18.45 Mb

Chr 17: 52.04 – 52.14 Mb

Publication PubMed

^[3]

^[4]

Wikidata

Voir/Editer Humain

Voir/Editer Souris

La protéine 1 de liaison aux séquences riches en AT (en anglais special AT-rich sequence-binding protein-1, SATB1) est une protéine codée chez l'humain par le gène SATB1^[5].

Fonction

SATB1 est un facteur de transcription et un organisateur global de la chromatine, qui a émergé comme un facteur clef dans l'intégration de l'architecture de la chromatine par l'intermédiaire de régulation de l'expression génique^[6]. Des études récentes ont révélé le rôle de SATB1 dans l'organisation de la chromatine loopscape et sa nature dynamique en réponse à des stimulations physiologiques^[7]. À niveau du génome, SATB1 semble jouer un rôle important dans l'organisation de la chromatine transcriptionnellement active. SATB1 organise le locus du CMH-I en diverses boucles de la chromatine, moyennant le recrutement de MARs à la matrice nucléaire à une distance fixe. Le silençage de SATB1 mime les effets du traitement avec l'interféron gamma dans l'architecture de la chromatine du locus du CMH-I, et altère l'expression de gènes à l'intérieur de ce locus. SATB1 aussi semble induire le cancer du sein et métastases en raison de l'altération de l'expression de nombreux gènes.

Interactions

La protéine SATB1 a démontré être capable d'interagir avec:

BAZ1A^[8],
CHD4^[8],
CUTL1^[9],
HDAC1^[8],
MTA2^[8],
POLR2J^[10]
SMARCA5^[8].

Notes et références

↑ ^{a b et c} GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000182568 - Ensembl, May 2017
↑ ^{a b et c} GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000023927 - Ensembl, May 2017
↑ « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
↑ « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
↑ « Entrez Gene: SATB1 SATB homeobox 1 »
↑ K. Pavan, P. umar, P. K. Purbey, C. K. Sinha, D. Notani, A. Limaye, R. S. Jayani et S. Galande, « Phosphorylation of SATB1, a global gene regulator, acts as a molecular switch regulating its transcriptional activity in vivo », Molecular Cell, vol. 22, n^o 2,‎ avril 2006, p. 231–43 (PMID 16630892, DOI 10.1016/j.molcel.2006.03.010)
↑ S. Galande, P. K. Purbey, D. Notani et P. P. Kumar, « The third dimension of gene regulation: organization of dynamic chromatin loopscape by SATB1 », Current Opinion in Genetics & Development, vol. 17, n^o 5,‎ octobre 2007, p. 408–14 (PMID 17913490, DOI 10.1016/j.gde.2007.08.003)
↑ ^{a b c d et e} D. Yasui, M. Miyano, S. Cai, P. Varga-Weisz et T. Kohwi-Shigematsu, « SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances », Nature, vol. 419, n^o 6907,‎ octobre 2002, p. 641–5 (PMID 12374985, DOI 10.1038/nature01084)
↑ J. Liu, A. Barnett, E. J. Neufeld et J. P. Dudley, « Homeoproteins CDP and SATB1 interact: potential for tissue-specific regulation », Molecular and Cellular Biology, vol. 19, n^o 7,‎ juillet 1999, p. 4918–26 (PMID 10373541, PMCID 84297, DOI 10.1128/mcb.19.7.4918)
↑ L. K. Durrin et T. G. Krontiris, « The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11 », Genomics, vol. 79, n^o 6,‎ juin 2002, p. 809–17 (PMID 12036295, DOI 10.1006/geno.2002.6772)

Liens externes

www.uniprot.org : fiche de la protéine SATB1 sur la banque de données UniProt.
Ressources relatives à la santé :
- Héritage mendélien chez l'humain
- Héritage mendélien chez l'humain