LDLRAP1

LDLRAP1
Visualisation de la protéine Cristallisée LDLRAP1
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

2G30

Identifiants
AliasesLDLRAP1, low-density lipoprotein receptor adaptor protein 1
IDs externesOMIM: 605747 MGI: 2140175 HomoloGene: 9219 GeneCards: LDLRAP1
Position du gène (Homme)
Chromosome 1 humain
Chr.Chromosome 1 humain[1]
Chromosome 1 humain
Localisation génomique pour LDLRAP1
Localisation génomique pour LDLRAP1
Locus1p36.11Début25,543,606 bp[1]
Fin25,568,886 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 4 (souris)
Chr.Chromosome 4 (souris)[2]
Chromosome 4 (souris)
Localisation génomique pour LDLRAP1
Localisation génomique pour LDLRAP1
Locus4|4 D3Début134,468,865 bp[2]
Fin134,495,335 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • cerebellar hemisphere

  • right hemisphere of cerebellum

  • C1 segment

  • granulocyte

  • rate

  • cellule endothéliale

  • ganglion lymphatique

  • body of pancreas

  • follicule pileux

  • îlot de Langerhans
Fortement exprimé dans
  • otic vesicle

  • saccule

  • otic placode

  • granulocyte

  • molaire

  • lèvre

  • lumbar subsegment of spinal cord

  • tibiofemoral joint

  • conjunctival fornix

  • calvaria
Plus de données d'expression de référence
BioGPS


Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • AP-2 adaptor complex binding
  • clathrin adaptor activity
  • phosphotyrosine residue binding
  • clathrin binding
  • amyloid-beta binding
  • signaling adaptor activity
  • low-density lipoprotein particle receptor binding
  • liaison protéique
  • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding
  • signaling receptor complex adaptor activity
  • AP-1 adaptor complex binding
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • AP-1 adaptor complex
  • recycling endosome
  • cytosol
  • basal plasma membrane
  • cytoplasmic side of plasma membrane
  • AP-2 adaptor complex
  • Neurofilament
  • axone
  • early endosome
  • membrane plasmique
  • clathrin-coated vesicle membrane
Processus biologique
  • positive regulation of receptor-mediated endocytosis
  • processus métabolique stéroidique
  • endocytose
  • receptor-mediated endocytosis involved in cholesterol transport
  • processus métabolique lipidique
  • internalisation de récepteur
  • amyloid precursor protein metabolic process
  • endocytose à récepteur
  • positive regulation of cholesterol metabolic process
  • cholesterol homeostasis
  • regulation of protein binding
  • cholesterol metabolic process
  • positive regulation of signal transduction
  • low-density lipoprotein particle clearance
  • organisation d'une membrane
  • positive regulation of receptor-mediated endocytosis involved in cholesterol transport
  • regulation of protein localization to plasma membrane
  • cholesterol transport
  • cellular response to cytokine stimulus
  • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation
  • positive regulation of low-density lipoprotein particle clearance
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

26119

100017

Ensembl

ENSG00000157978

ENSMUSG00000037295

UniProt

Q5SW96

Q8C142

RefSeq (mRNA)

NM_015627

NM_145554

RefSeq (protéine)

NP_056442

NP_663529

Localisation (UCSC)Chr 1: 25.54 – 25.57 MbChr 4: 134.47 – 134.5 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Le LDLRAP1 (pour « low-density lipoprotein receptor adaptor protein 1 ») est une protéine adaptatrice dont le gène est LDLRAP1 situé sur le chromosome 1 humain.

Rôles

Il se fixe sur la partie endocellulaire du récepteur aux LDL permettant l'internalisation du couple LDLR-LDL[5].

En médecine

Une mutation du gène est responsable d'une forme rare d'hypercholestérolémie familiale, l'hypercholestérolémie autosomale récessive[6].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000157978 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037295 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Garuti R, Jones C, Li WP et al. The modular adaptor protein autosomal recessive hypercholesterolemia (ARH) promotes low-density lipoprotein receptor clustering into clathrin-coated pits, J Biol Chem, 2005;280:40996–41004
  6. Garcia CK, Wilund K, Arca M et al. Autosomal recessive hypercholesterolemia caused by mutations in a putative LDL receptor adaptor protein, Science, 2001;292:1394–1398
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