KIF1A

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KIF1A
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

4EGX, 4EJQ, 4UXO, 4UXP, 4UXR, 4UXS

Identifiants
AliasesKIF1A, Kinesin-like protein KIF1Apathie
IDs externesOMIM: 601255 MGI: 108391 HomoloGene: 99729 GeneCards: KIF1A
Position du gène (Homme)
Chromosome 2 humain
Chr.Chromosome 2 humain[1]
Chromosome 2 humain
Localisation génomique pour KIF1A
Localisation génomique pour KIF1A
Locus2q37.3Début240,713,761 bp[1]
Fin240,821,036 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 1 (souris)
Chr.Chromosome 1 (souris)[2]
Chromosome 1 (souris)
Localisation génomique pour KIF1A
Localisation génomique pour KIF1A
Locus1|1 DDébut92,943,186 bp[2]
Fin93,029,673 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • right frontal lobe

  • gyrus postcentral

  • lateral nuclear group of thalamus

  • Vermis du cervelet

  • pont

  • cortex cingulaire antérieur

  • Pars compacta

  • right hemisphere of cerebellum

  • amygdale

  • dorsolateral prefrontal cortex
Fortement exprimé dans
  • gyrus frontal supérieur

  • dentate gyrus of hippocampal formation granule cell

  • neural layer of retina

  • cerebellar cortex

  • medial dorsal nucleus

  • primary visual cortex

  • habenula

  • dorsomedial hypothalamic nucleus

  • medial geniculate nucleus

  • pontine nuclei
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
n/a
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • microtubule binding
  • microtubule motor activity
  • liaison nucléotide
  • activité ATPase
  • cytoskeletal motor activity
  • liaison ATP
  • identical protein binding
  • protein homodimerization activity
  • plus-end-directed microtubule motor activity
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • microtubule
  • cytosquelette
  • Kinésine
  • axon cytoplasm
  • axone
  • cytosol
  • vésicule synaptique
  • dendrite
  • neuronal cell body
  • présynapse
  • postsynapse
  • complexe macromoléculaire
  • neuron projection
Processus biologique
  • microtubule-based movement
  • anterograde axonal transport
  • interkinetic nuclear migration
  • protein transport along microtubule
  • vesicle-mediated transport
  • cytoskeleton-dependent intracellular transport
  • anterograde neuronal dense core vesicle transport
  • retrograde neuronal dense core vesicle transport
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

547

16560

Ensembl

ENSG00000130294

ENSMUSG00000014602

UniProt

Q12756

P33173

RefSeq (mRNA)

NM_001244008
NM_004321
NM_001320705
NM_001330289
NM_001330290

NM_001110315
NM_001294149
NM_001294150
NM_008440
NM_001368847

RefSeq (protéine)

NP_001230937
NP_001307634
NP_001317218
NP_001317219
NP_004312

n/a

Localisation (UCSC)Chr 2: 240.71 – 240.82 MbChr 1: 92.94 – 93.03 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

En génétique, KIF1A (acronyme de Kinesin-like protein KIF1Apathie en anglais) est le nom d'un gène codant une kinésine motrice éponyme, c'est-à-dire une protéine associée aux microtubules du chromosome 2 humain[5]. Cette protéine est à son tour impliquée dans le transport des vésicules synaptiques le long des axones.

En d'autres termes, le gène KIF1A donne des instructions fondamentales pour la production de la protéine KIF1A, une protéine dite motrice, car cruciale pour l'activation et le contrôle du transport des nutriments dans les cellules nerveuses le long des neurones, et donc por la bonne santé des cellules cérébrales. C'est pourquoi KIF1A est aussi qualifié de transporteur protéique localisé dans le trafic axonal de vésicules synaptiques (axonal transporter of synaptic vesicles) ou moteur amarré aux microtubules (microtubule-based motor KIF1A) du chromosome précité.

KIF1A est connu du grand public pour le rôle que joue son dysfonctionnement dans des maladies neurodegeneratives rarissimes.

Fonction

Le gène KIF1A est ainsi responsable de l'activation des protéines du système de transmission glutamatergique, le glutamate en étant l'excitateur ubiquitaire dans le système nerveux central[6].

KIF1A est une protéine membre de la famille des kinesines, des protéines qui se déplacent en utilisant l'énergie de l'hydrolyse. Cette protéine est extrèmement proche de la protéine 1A, membre de la kinésine à chaîne lourde de la souris grise (Mus musculus), qui est une protéine motrice antérograde transportant les organites membranaires le long des microtubules axonaux.

L'orientation sexuelle a été liée au domaine de régulation du gène.

Mutations

Plus de 80 altérations ou mutations du gène KIF1A ont été identifiées, provoquant le développement de neuropathies très hétérogènes avec de multiples symptômes associés[7].

En effet, les mutations observées sont quasi exclusivement du type recessif et localisées dans le transport axonal des kinésines. Elles sont à l’origine de la paraplégie spastique héréditaire (SPG30)[8] et de la neuropathie sensitive (HSAN2). Plusieurs auteurs rendent des mutations hétérozygotes de novo de KIF1A responsables d’une pathologie neurodégénérative associant retard de développement précoce puis atrophie optique, spasticité et atrophie cérébelleuse[9].

Liens externes

  • KIF1A sur orpha.net
  • Kif1a.org/ site destiné aux familles touchées et aux soignants, avec des liens vers des publications ad hoc récentes[10].
  • Kif1a.fr site francophone sur les maladies liées au gène KIF1A.
  • KIF1A France association de familles Française touchées par KIF1A. 

Références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000130294 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000014602 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. « Entrez Gene: kinesin family member 1A »
  6. Consulter Inserm. Déficiences intellectuelles. Collection Expertise collective. Montrouge : EDP Sciences, 2016, chap 3 disponible sur http://www.ipubli.inserm.fr/bitstream/handle/10608/6816/Chapitre_3.html
  7. consulter https://www.kif1a.org/kif1a-gene/ (en anglais)
  8. consulter Guillaume Banneau, "CO036 : L’implication du gène KIF1A/SPG30 dans le diagnostic moléculaire des paraplégies spastiques héréditaires : un gène majeur" Auteurs : Guillaume Banneau avec Laurène Tissier, Bophara Kol, Estelle Fedirko, Isabelle David, Laure Raymond, Alexandra Durr, Caroline Nava, Fabienne Clot, Cécile Cazeneuve, Eric Leguern, Fédération de Génétique, CHU Pitié-Salpêtrière, Paris et Giovanni Stevanin, Centre de Recherche de l’Institut du Cerveau et de la Moelle épinière (INSERM/UPMC UMR_S 975, CNRS 7225, NEB), Paris sur https://assises-genetique.org/medias/files/abstracts2018.pdf p 46
  9. consulter Alexandra Afenjar. P107 : Ataxie congénitale révélant une « KIF1Apathie » Auteurs Alexandra Afenjar et alterii, CRMR des malformations et maladies congénitales du cervelet, CRMR déficiences intellectuelles de causes rares, Département de génétique et embryologie médicale, GH Trousseau, APHP, Paris, et GRC ConCer-LD, Sorbonne Universités, UPMC Universités, Paris sur https://assises-genetique.org/medias/files/abstracts2018.pdf p 246
  10. liste https://www.kif1a.org/research/current-studies/
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