ATF6

ATF6
Identifiants
AliasesATF6, ATF6A, ACHM7, activation du facteur de transcription 6
IDs externesOMIM: 605537 MGI: 1926157 HomoloGene: 32015 GeneCards: ATF6
Position du gène (Homme)
Chromosome 1 humain
Chr.Chromosome 1 humain[1]
Chromosome 1 humain
Localisation génomique pour ATF6
Localisation génomique pour ATF6
Locus1q23.3Début161,766,298 bp[1]
Fin161,977,574 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 1 (souris)
Chr.Chromosome 1 (souris)[2]
Chromosome 1 (souris)
Localisation génomique pour ATF6
Localisation génomique pour ATF6
Locus1 H3|1 76.96 cMDébut170,532,243 bp[2]
Fin170,695,340 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • corpus epididymis

  • skin of hip

  • skin of thigh

  • épithélium pigmentaire rétinien

  • tail of epididymis

  • jointure synoviale

  • caput epididymis

  • vésicule séminale

  • Veine saphène

  • cellule endothéliale
Fortement exprimé dans
  • myocardium of ventricle

  • glande lacrymale

  • glande submandibulaire

  • myocarde

  • cardiac muscle tissue of left ventricle

  • ventricule droit

  • vésicule séminale

  • secondary oocyte

  • stroma of bone marrow

  • valve aortique
Plus de données d'expression de référence
BioGPS


Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison ADN
  • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription factor activity
  • transcription coactivator activity
  • transcription cis-regulatory region binding
  • liaison protéique
  • identical protein binding
  • protein heterodimerization activity
  • ubiquitin protein ligase binding
  • cAMP response element binding
  • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
  • sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Composant cellulaire
  • integral component of membrane
  • appareil de Golgi
  • enveloppe nucléaire
  • membrane
  • membrane du réticulum endoplasmique
  • Golgi membrane
  • nucléoplasme
  • integral component of endoplasmic reticulum membrane
  • réticulum endoplasmique
  • noyau
  • cytosol
Processus biologique
  • développement de l'œil
  • regulation of transcription, DNA-templated
  • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress
  • regulation of transcription by RNA polymerase II
  • transcription, DNA-templated
  • endoplasmic reticulum unfolded protein response
  • ATF6-mediated unfolded protein response
  • response to unfolded protein
  • repliement de protéine
  • transduction de signal
  • vue
  • positive regulation of apoptotic process
  • transcription by RNA polymerase II
  • positive regulation of transcription by RNA polymerase II
  • positive regulation of ATF6-mediated unfolded protein response
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

22926

226641

Ensembl

ENSG00000118217

ENSMUSG00000026663

UniProt

P18850

F6VAN0

RefSeq (mRNA)

NM_007348

NM_001081304

RefSeq (protéine)

NP_031374

NP_001074773

Localisation (UCSC)Chr 1: 161.77 – 161.98 MbChr 1: 170.53 – 170.7 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

L'ATF6 (pour « Activating transcription factor 6 ») est un facteur de transcription de la famille des ATF. Son gène est ATF6 situé sur le chromosome 1 humain.

Rôles

Il s'agit d'un récepteur transmembranaire situé sur le réticulum endoplasmique, qui, avec le IRE1 et le PERK, constituent un senseur de protéines mal repliés[5].

Elle interagit avec la protéine DREAM, cette interaction étant inhibée par le répaglinide[6].

En médecine

La protéine est moins active en cas de maladie de Huntington[7].

Notes et références

  1. ↑ a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000118217 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026663 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. ↑ « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. ↑ Chakrabarti11" A, Chen AW, Varner JD, A review of the mammalian unfolded protein response, Biotechnol Bioeng, 2011;108:2777–2793.
  6. ↑ Naranjo JR, Zhang H, Villar D et al. Activating transcription factor 6 derepression mediates neuroprotection in Huntington disease, J Clin Invest, 2016;126:627-638
  7. ↑ Fernandez-Fernandez MR, Ferrer I, Lucas JJ, Impaired ATF6α processing, decreased Rheb and neuronal cell cycle re-entry in Huntington’s disease, Neurobiol Dis, 2011;41:23–32
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