SRGAP2

Infotaula de genSRGAP2
Estructures disponibles
PDBCerca ortòloga: PDBe RCSB
Llista de codis id de PDB

4RTT, 4RUG, 2DL8

ÀliesSRGAP2 (HUGO), ARHGAP34, FNBP2, SRGAP2A, SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2
Identif. externsOMIM 606524   MGI 109605   HomoloGene: 52683   GeneCards: SRGAP2   OMA: SRGAP2 - orthologs
Localització del gen (humà)
Cromosoma 1 (humà)
Crom.Cromosoma 1 (humà)[1]
Cromosoma 1 (humà)
Localització genòmica per SRGAP2
Localització genòmica per SRGAP2
Banda1q32.1Inici206.203.346 bp[1]
Fi206.464.436 bp[1]
Localització del gen (ratolí)
Cromosoma 1 (ratolí)
Crom.Cromosoma 1 (ratolí)[2]
Cromosoma 1 (ratolí)
Localització genòmica per SRGAP2
Localització genòmica per SRGAP2
Banda1|1 E4Inici131.212.989 bp[2]
Fi131.455.090 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN
Bgee
humàratolí (ortòleg)
Més explicacions
  • cerebellar hemisphere Podeu traduir-lo

  • right hemisphere of cerebellum Podeu traduir-lo

  • nervi sural Podeu corregir-lo

  • paraflocculus of cerebellum Podeu traduir-lo

  • ventricular zone Podeu traduir-lo

  • skin of leg Podeu traduir-lo

  • eminència ganglionar Podeu corregir-lo

  • pell de l'abdomen Podeu corregir-lo

  • C1 segment Podeu traduir-lo

  • monòcit
Més explicacions
  • lumbar subsegment of spinal cord Podeu traduir-lo

  • cerebellar cortex Podeu traduir-lo

  • tail of embryo Podeu traduir-lo

  • lobe of cerebellum Podeu traduir-lo

  • cerebellar vermis Podeu traduir-lo

  • stroma of bone marrow Podeu traduir-lo

  • Rostral migratory stream Podeu traduir-lo

  • superior frontal gyrus Podeu traduir-lo

  • dentate gyrus of hippocampal formation granule cell Podeu traduir-lo

  • llavi
Més dades d'expressió de referència
BioGPS
Ontologia genètica
Funció molecular
  • protein homodimerization activity Podeu traduir-lo
  • unió proteica 
  • GTPase activator activity Podeu traduir-lo
  • unió de proteïnes idèntica Podeu corregir-lo
Component cel·lular
  • citoplasma 
  • citosol 
  • postsynaptic membrane Podeu traduir-lo
  • cell projection Podeu traduir-lo
  • membrana Podeu corregir-lo
  • postsynaptic density Podeu traduir-lo
  • dendritic spine Podeu traduir-lo
  • sinapsi 
  • Unió cel·lular 
  • dendritic spine head Podeu traduir-lo
  • phagocytic vesicle Podeu traduir-lo
  • cytoplasmic vesicle Podeu traduir-lo
  • nucli cel·lular 
  • lamel·lipodi 
  • membrana plasmàtica 
  • nucleoplasma 
Procés biològic
  • lamellipodium assembly involved in ameboidal cell migration Podeu traduir-lo
  • negative regulation of neuron migration Podeu traduir-lo
  • neuron projection morphogenesis Podeu traduir-lo
  • actin filament severing Podeu traduir-lo
  • filopodium assembly Podeu traduir-lo
  • negative regulation of cell death Podeu traduir-lo
  • desenvolupament neuronal Podeu corregir-lo
  • dendritic spine development Podeu traduir-lo
  • substrate adhesion-dependent cell spreading Podeu traduir-lo
  • extension of a leading process involved in cell motility in cerebral cortex radial glia guided migration Podeu traduir-lo
  • proliferació cel·lular 
  • regulation of small GTPase mediated signal transduction Podeu traduir-lo
  • transducció de senyal 
  • positive regulation of GTPase activity Podeu traduir-lo
  • negative regulation of cell migration Podeu traduir-lo
Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs
EspèciesHumàRatolí
Entrez

23380

14270

Ensembl

ENSG00000266028

ENSMUSG00000026425

UniProt

O75044

Q91Z67

RefSeq (ARNm)
NM_001042758
NM_001170637
NM_001300952
NM_015326
NM_001377444

NM_001377445
NM_001377446
NM_001377447

NM_001081011
NM_019520

RefSeq (proteïna)
NP_001164108
NP_001287881
NP_056141
NP_001364373
NP_001364374

NP_001364375
NP_001364376

NP_001074480

Localització (UCSC)Chr 1: 206.2 – 206.46 MbChr 1: 131.21 – 131.46 Mb
Cerca a PubMed[3][4]
Wikidata
Veure/Editar HumàVeure/Editar Ratolí

SRGAP2 és l'acrònim de l'anglès SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2 amb què s'identifica la proteïna SLIT-ROBO activadora de GTPasa Rho 2, també coneguda per proteïna d'unió a la formina 2 (FNBP2). A més de l'espècie humana, el gen que la codifica (SRGAP2[5]) ha estat identificat en deu altres espècies de mamífers, com ara ratolins o primats.[6]

La família a què pertany, les proteïnes SLIT-ROBO activadores de GTPasa Rho (SRGAP1,2,3) regulen el citoesquelet d'actina a través de l'acció inhibidora que exerceixen en GTPases petites (Rac1, RhoA, Cdc42).[7]

Funcions

SRGAP2 intervé en la migració neuronal, en la formació de les ramificacions neuronals[6] i en el desenvolupament sinàptic.[8] SRGAP2C retarda la maduració d'algunes neurones i fa augmentar la densitat de les espines dendrítiques. La infraregulació de SRGAP2 inhibeix la repulsió entre cèl·lula i cèl·lula i reforça la durada de contacte entre cèl·lula i cèl·lula.

Duplicació del gen

El gen que codifica aquesta proteïna és un dels 23 que apareixen duplicats en l'espècie humana però no als altres primats.[9]

El gen ancestral SRGAP2 apareix als genomes de tots els mamífers. Al genoma humà, s'ha anomenat SRGAP2A per distingir-lo de les tres duplicacions que es van produir posteriorment (SRGAP2B, SRGAP2C i SRGAP2D). La primera duplicació (SRGAP2b) va tenir lloc fa uns 3,4 milions d'anys, quan l'exó promotor i els nou primers exons d'un total de 22 es van copiar des de 1q32.1 fins a 1q21.1. Dues duplicacions posteriors van copiar SRGAP2b a 1p12, fa uns 2,4 milions d'anys, i a 1q21, fa un milió d'anys aproximadament.[6]

La versió SRGAP2c, escurçada com s'ha dit, inhibeix la funció del gen ancestral i permet una migració més ràpida de neurones a còpia de disminuir la producció de filopodis i d'alentir la maduració sinàptica, a més d'augmentar la densitat sinàptica al còrtex cerebral.

Referències

  1. 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000266028 - Ensembl, May 2017
  2. 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026425 – Ensembl, May 2017
  3. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. Madura T, Yamashita T, Kubo T, Tsuji L, Hosokawa K, Tohyama M «Changes in mRNA of Slit-Robo GTPase-activating protein 2 following facial nerve transection». Brain Research. Molecular Brain Research, 123 (1-2), 2004, p. 76–80.
  6. 6,0 6,1 6,2 Dennis MY, Nuttle X, Sudmant PH, Antonacci F, Graves TA, Nefedov M, Rosenfeld JA, Sajjadian S, Malig M, Kotkiewicz H, Curry CJ, Shafer S, Shaffer LG, de Jong PJ, Wilson RK, Eichler EE. «Evolution of Human-Specific Neural SRGAP2 Genes by Incomplete Segmental Duplication». Cell, 149(4), 2012, p. 912-22.
  7. Blockus, H., Alain Chédotal, A. «The multifaceted roles of Slits and Robos in cortical circuits: from proliferation to axon guidance and neurological diseases». Current Opinion in Neurobiology, 27, 2014, p. 82-88.
  8. Fossati M, Pizzarelli R, Schmidt ER, Kupferman JV, Stroebel D, Polleux F, Charrier C «SRGAP2 and Its Human-Specific Paralog Co- Regulate the Development of Excitatory and Inhibitory Synapses». Neuron, 91, 2016, p. 356–369.
  9. Sudmant PH, Kitzman JO, Antonacci F, Alkan C, Malig M, Tsalenko A, Sampas N, Bruhn L, Shendure J, Eichler EE «Diversity of human copy number variation and multicopy genes». Science, 330, 2010, p. 641–646.