Neurotrimin

Neurotrimin
Àlies	NTM (HUGO), HNT, IGLON2, NTRI, neurotrimin, CEPU-1
Identif. externs	OMIM 607938   MGI 2446259   HomoloGene: 41139   GeneCards: NTM   OMA: NTM - orthologs
Localització del gen (humà) Crom. Cromosoma 11 (humà)[1] Banda 11q25 Inici 131.370.478 bp[1] Fi 132.336.822 bp[1]
Localització del gen (ratolí) Crom. Cromosoma 9 (ratolí)[2] Banda 9|9 A4 Inici 28.906.046 bp[2] Fi 29.874.437 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN Bgee humà ratolí (ortòleg) Més explicacions right hemisphere of cerebellum  cerebellar vermis  primary visual cortex  middle temporal gyrus  Gir postcentral Brodmann area 23  superior frontal gyrus  cos callós right frontal lobe  àrea 9 de Brodmann Més explicacions primary motor cortex  còrtex visual cerebellar cortex  primary visual cortex  cerebellar vermis  lobe of cerebellum  superior frontal gyrus  còrtex prefrontal mammillary body  Nucli geniculat lateral Més dades d'expressió de referència BioGPS Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica Funció molecular unió proteica  Component cel·lular component ancorat de la membrana  membrana  regió extracel·lular  membrana plasmàtica  Procés biològic reconeixement de neurones  adherència cel·lular  Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs Espècies Humà Ratolí Entrez 50863 235106 Ensembl ENSG00000182667 ENSMUSG00000059974 UniProt Q9P121 Q99PJ0 RefSeq (ARNm) NM_001048209 NM_001144058 NM_001144059 NM_016522 NM_001352001 NM_001352002 NM_001352003 NM_001352004 NM_001352005 NM_001352006 NM_001352007 NM_001352008 NM_001352009 NM_172290 NM_001357593 NM_001357597 NM_001357598 NM_001357601 NM_001357602 NM_001357603 RefSeq (proteïna) NP_001041674 NP_001137530 NP_001137531 NP_057606 NP_001338930 NP_001338931 NP_001338932 NP_001338933 NP_001338934 NP_001338935 NP_001338936 NP_001338937 NP_001338938 NP_758494 NP_001344522 NP_001344526 NP_001344527 NP_001344530 NP_001344531 NP_001344532 Localització (UCSC) Chr 11: 131.37 – 132.34 Mb Chr 9: 28.91 – 29.87 Mb Cerca a PubMed [3] [4]
Wikidata
Veure/Editar Humà Veure/Editar Ratolí

El neurotrimin és una proteïna que en humans està codificada pel gen NTM.^[5][6]

Aquest gen codifica un membre de la família IgLON (LAMP, OBCAM, Ntm) de immunoglobulina (Ig) que dominen-contenen glicosilfosfatidilinositol (GPI) ancorades a les molècula d'adhesió cel·lular. La proteïna codificada pot promoure el creixement i l'adhesió de neurites a través d'un mecanisme homòfil. Aquest gen està estretament lligat a un membre d'una família relacionada, un opioide d'unió proteïna / molècula d'adhesió cel·lular (OPCML), en el cromosoma 11. S'han trobat diverses variants alternades alternativament, però només dues variants han tingut les seqüències de longitud completa determinades.^[6]

• Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB «Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery.». Genome Res., 6, 9, 1997, pàg. 791–806. DOI: 10.1101/gr.6.9.791. PMID: 8889548.
• Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, et al «Expressed sequence tag analysis of human RPE/choroid for the NEIBank Project: over 6000 non-redundant transcripts, novel genes and splice variants.». Mol. Vis., 8, 2002, pàg. 205–20. PMID: 12107410.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 99, 26, 2003, pàg. 16899–903. DOI: 10.1073/pnas.242603899. PMC: 139241. PMID: 12477932.
• Sellar GC, Watt KP, Rabiasz GJ, et al «OPCML at 11q25 is epigenetically inactivated and has tumor-suppressor function in epithelial ovarian cancer.». Nat. Genet., 34, 3, 2003, pàg. 337–43. DOI: 10.1038/ng1183. PMID: 12819783.
• Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al «The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment.». Genome Res., 13, 10, 2003, pàg. 2265–70. DOI: 10.1101/gr.1293003. PMC: 403697. PMID: 12975309.
• Zhang Z, Henzel WJ «Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites.». Protein Sci., 13, 10, 2005, pàg. 2819–24. DOI: 10.1110/ps.04682504. PMC: 2286551. PMID: 15340161.
• Liu J, Li G, Peng X, et al «The cloning and preliminarily functional analysis of the human neurotrimin gene.». Sci. China, C, Life Sci., 47, 2, 2004, pàg. 158–64. DOI: 10.1360/03yc0072. PMID: 15379248.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al «The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).». Genome Res., 14, 10B, 2004, pàg. 2121–7. DOI: 10.1101/gr.2596504. PMC: 528928. PMID: 15489334.